RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620385.1

CTXN3-204, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CTXN3, Length 1,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-204ENST00000620385 LDHBP07195 334 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 H2AFB1P0C5Y9 115 aa9.45□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 H2AFB2P0C5Z0 115 aa9.45□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 RTN1Q16799 776 aa9.45□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 SLFNL1Q499Z3 407 aa9.45□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 GAS2L3Q86XJ1 694 aa9.45□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 BICD2Q8TD16 824 aa9.45□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa9.45□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 CLSTN2Q9H4D0 955 aa9.45□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 RCOR1Q9UKL0 485 aa9.45□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 PSME4Q14997 1843 aa9.45□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 BMP15O95972 392 aa9.44□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 SERPINB2P05120 415 aa9.44□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 NID1P14543 1247 aa9.44□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 IL1R1P14778 569 aa9.44□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 IARSP41252 1262 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 CCT2P78371 535 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 MECOMQ03112 1051 aa9.44□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 TXNRD1Q16881 649 aa9.44□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 CYB5R4Q7L1T6 521 aa9.44□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 CATIPQ7Z7H3 387 aa9.44□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 FERMT3Q86UX7 667 aa9.44□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 MICU3Q86XE3 530 aa9.44□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 MICALL1Q8N3F8 863 aa9.44□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 BANK1Q8NDB2 785 aa9.44□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 DDX11Q96FC9 970 aa9.44□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 TNMDQ9H2S6 317 aa9.44□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa9.44□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 GDPD2Q9HCC8 539 aa9.44□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 BRPF3Q9ULD4 1205 aa9.44□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa9.44□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 TNKSO95271 1327 aa9.44□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 MYH1P12882 1939 aa9.43□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 PLIN4Q96Q06 1357 aa9.43□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 FAM205AQ6ZU69 1335 aa9.43□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 MYO3BQ8WXR4 1341 aa9.43□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 KINO60870 393 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 NPR1P16066 1061 aa9.43□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 PDE6BP35913 854 aa9.43□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 FAM160A1Q05DH4 1040 aa9.43□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 MTFR1Q15390 333 aa9.43□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 PTF1AQ7RTS3 328 aa9.43□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 ZNF654Q8IZM8 581 aa9.43□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 MIGA1Q8NAN2 632 aa9.43□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 ALG1Q9BT22 464 aa9.43□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 BRMS1Q9HCU9 246 aa9.43□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 ZSWIM5Q9P217 1185 aa9.43□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 CEP131Q9UPN4 1083 aa9.43□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 PARP3Q9Y6F1 533 aa9.43□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 GAKO14976 1311 aa9.42□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 TMEM229AB2RXF0 380 aa9.42□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 CDK2AP1O14519 115 aa9.42□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 PPP6R2O75170 966 aa9.42□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 UFL1O94874 794 aa9.42□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 TPM3P06753 285 aa9.42□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 FDPSP14324 419 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP9.42□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 ALDH1B1P30837 517 aa9.42□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 KIF5BP33176 963 aa9.42□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 TXLNAP40222 546 aa9.42□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 MBTPS1Q14703 1052 aa9.42□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 NTRK3Q16288 839 aa9.42□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 ADALQ6DHV7 355 aa9.42□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 SP8Q8IXZ3 490 aa9.42□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 FAM200AQ8TCP9 573 aa9.42□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 TNFRSF25Q93038 417 aa9.42□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 CCDC34Q96HJ3 373 aa9.42□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 EYA3Q99504 573 aa9.42□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 SLC30A3Q99726 388 aa9.42□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 FUCA2Q9BTY2 467 aa9.42□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 COA1Q9GZY4 146 aa9.42□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 TOMM22Q9NS69 142 aa9.42□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 CCDC39Q9UFE4 941 aa9.42□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 A0A0G2JLW4 131 aa9.41□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 A6NJY4 79 aa9.41□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 SNAP23O00161 211 aa9.41□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 GNAQP50148 359 aa9.41□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 KCNQ4P56696 695 aa9.41□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 ADGRE1Q14246 886 aa9.41□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 STK38Q15208 465 aa9.41□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 SEC23AQ15436 765 aa9.41□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 RILPL1Q5EBL4 403 aa9.41□□□□□ -0.9
CTXN3-204ENST00000620385 CHST3Q7LGC8 479 aa9.41□□□□□ -0.9
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