RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 GMNCA6NCL1 334 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 IL2RBP14784 551 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 MAP3K12Q12852 859 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 PLCB4Q15147 1175 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 C8orf74Q6P047 294 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 CPLX4Q7Z7G2 160 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 CREG2Q8IUH2 290 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC50Q8IVM0 306 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 FBXO41Q8TF61 875 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 HOOK2Q96ED9 719 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 AGXT2Q9BYV1 514 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP9.07□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 STIM2Q9P246 746 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 PLAAQ9Y263 795 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 RFX7Q2KHR2 1363 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 A0A087X0B3 334 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 DCDC2CA8MYV0 355 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 KLRK1P26718 216 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 PTPROQ16827 1216 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 SLC26A6Q9BXS9 759 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 LRWD1Q9UFC0 647 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 STK38LQ9Y2H1 464 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 MGRN1O60291 552 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 SMIM24O75264 130 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 ECEL1O95672 775 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 PYGBP11216 843 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 IARSP41252 1262 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 ABL2P42684 1182 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 BCAMP50895 628 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 COPB1P53618 953 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 ANTXR2P58335 489 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC96Q2M329 555 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 ALS2CLQ60I27 953 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 SLC30A9Q6PML9 568 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 CADPS2Q86UW7 1296 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 KIF2BQ8N4N8 673 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC63Q8NA47 563 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 GPR108Q9NPR9 543 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 LMCD1Q9NZU5 365 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 DCCP43146 1447 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 GOLGA8AA7E2F4 631 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 PPP6R2O75170 966 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 PDHA1P08559 390 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 EPB41P11171 864 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 ICA1Q05084 483 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 NR5A1Q13285 461 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 LAMB3Q13751 1172 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 RRAGBQ5VZM2 374 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 SPDYE5A6NIY4 337 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 MINDY4BA8MYZ0 360 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 KRT86O43790 486 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 EVI5O60447 810 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 ITGA6P23229 1130 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 SARSP49591 514 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 TUBP50607 506 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 VAV2P52735 878 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 KCNJ2P63252 427 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM67Q5HYA8 995 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 WDR59Q6PJI9 974 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 KIF6Q6ZMV9 814 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 ERICH1Q86X53 443 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 CSRNP2Q9H175 543 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 LMO7Q8WWI1 1683 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 TRIM49BA6NDI0 452 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 ZBTB43O43298 467 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 CDKL5O76039 1030 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 GYG1P46976 350 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 XRCC4Q13426 336 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 CDKAL1Q5VV42 579 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 IQCKQ8N0W5 287 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 TRIM58Q8NG06 486 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 SDR42E1Q8WUS8 393 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 RAPGEF5Q92565 580 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRT-211ENST00000618610 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa9.05□□□□□ -0.96
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