RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612839.1

CCL3L3-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3L3, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-201ENST00000612839 UNC93B1Q9H1C4 597 aa13.15□□□□□ -0.3
CCL3L3-201ENST00000612839 CYP39A1Q9NYL5 469 aa13.15□□□□□ -0.3
CCL3L3-201ENST00000612839 CCL5P13501 91 aa13.14□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 CYP2C19P33261 490 aa13.14□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 GNAQP50148 359 aa13.14□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 RCAN1P53805 252 aa13.14□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 EVCP57679 992 aa13.14□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 TMTC3Q6ZXV5 915 aa13.14□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 FBXO11Q86XK2 927 aa13.14□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM133AQ8N9E0 248 aa13.14□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 FGD4Q96M96 766 aa13.14□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 LZTS2Q9BRK4 669 aa13.14□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 AMNQ9BXJ7 453 aa13.14□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 PFASO15067 1338 aa13.13□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 ABCB11O95342 1321 aa13.13□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 MCM3APO60318 1980 aa13.13□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa13.13□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 CDC27P30260 824 aa13.13□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 SOX10P56693 466 aa13.13□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 CNTN2Q02246 1040 aa13.13□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 RTN1Q16799 776 aa13.13□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 MFSD14CQ5VZR4 134 aa13.13□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 NSMFQ6X4W1 530 aa13.13□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 CCDC82Q8N4S0 544 aa13.13□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 RNF208Q9H0X6 261 aa13.13□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 NID2Q14112 1375 aa13.13□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 ASTN1O14525 1302 aa13.13□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 RPTORQ8N122 1335 aa13.13□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 SOWAHBA6NEL2 793 aa13.12□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 GOLGA8AA7E2F4 631 aa13.12□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 GOLGA8BA8MQT2 603 aa13.12□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 OPLAHO14841 1288 aa13.12□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 FUT2Q10981 343 aa13.12□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC30A10Q6XR72 485 aa13.12□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 RNF207Q6ZRF8 634 aa13.12□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 PIBF1Q8WXW3 757 aa13.12□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 TINF2Q9BSI4 451 aa13.12□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 PDRG1Q9NUG6 133 aa13.12□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa13.12□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 PTPDC1A2A3K4 754 aa13.11□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 GJB1P08034 283 aa13.11□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 CYBAP13498 195 aa13.11□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 ADD1P35611 737 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP13.11□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 RPS6P62753 249 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 PPP2R5BQ15173 497 aa13.11□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa13.11□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 RGS22Q8NE09 1264 aa13.11□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 TRPV1Q8NER1 839 aa13.11□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 TBC1D5Q92609 795 aa13.11□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP13.11□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa13.11□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 FRMPD3Q5JV73 1810 aa13.1□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa13.1□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 CALML3P27482 149 aa13.1□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 RBM25P49756 843 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa13.1□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 KIF2CQ99661 725 aa13.1□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 C22orf23Q9BZE7 217 aa13.1□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa13.1□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 EN2P19622 333 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 GJA8P48165 433 aa13.1□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 CCT2P78371 535 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 GHRHRQ02643 423 aa13.1□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 TRAF1Q13077 416 aa13.1□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 MCF2L2Q86YR7 1114 aa13.1□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 DEFB118Q96PH6 123 aa13.1□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 MAF1Q9H063 256 aa13.1□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 LRRC37A2A6NM11 1700 aa13.09□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa13.09□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 SGPL1O95470 568 aa13.09□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 NEK4P51957 841 aa13.09□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 AK2P54819 239 aa13.09□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 NTRK3Q16288 839 aa13.09□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 ARMCX2Q7L311 632 aa13.09□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CCL3L3-201ENST00000612839 SHISA4Q96DD7 197 aa13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms