RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	TTC14	Q96N46	770 aa		16.38	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	16.38	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	16.38	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		16.38	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	B4GALT4	O60513	344 aa		16.37	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	PBX2	P40425	430 aa		16.37	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF543	Q08ER8	600 aa		16.37	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	16.37	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	16.37	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		16.37	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		16.37	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	TOMM22	Q9NS69	142 aa		16.37	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	16.37	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		16.37	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		16.37	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	TTC28	Q96AY4	2481 aa		16.37	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		16.36	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	EDNRB	P24530	442 aa		16.36	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	PSMC6	P62333	389 aa		16.36	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		16.36	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		16.36	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		16.36	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	USP38	Q8NB14	1042 aa		16.36	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	VWCE	Q96DN2	955 aa		16.36	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		16.36	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		16.36	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	16.36	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		16.36	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	LCT	P09848	1927 aa		16.35	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	NT5C2	P49902	561 aa		16.35	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	HAND2	P61296	217 aa		16.35	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	16.35	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	AAMP	Q13685	434 aa		16.35	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	RAB30	Q15771	203 aa		16.35	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	SMC5	Q8IY18	1101 aa		16.35	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	16.35	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		16.34	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	FGB	P02675	491 aa		16.34	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	CPT1A	P50416	773 aa		16.34	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	16.34	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		16.34	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		16.34	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	DNER	Q8NFT8	737 aa		16.34	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	LNPK	Q9C0E8	428 aa		16.34	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	16.34	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		16.34	■□□□□ 0.21
MUC1-222	ENST00000610468	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	16.33	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		16.33	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	CALML3	P27482	149 aa		16.33	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	CCL23	P55773	120 aa		16.33	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	16.33	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	DGKH	Q86XP1	1220 aa		16.33	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	RGS22	Q8NE09	1264 aa		16.33	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	ESR2	Q92731	530 aa		16.33	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	MAF1	Q9H063	256 aa		16.33	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		16.33	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	NEDD4	P46934	1319 aa		16.33	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468		A6NJR5	290 aa		16.32	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	TNKS	O95271	1327 aa		16.32	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	SDS	P20132	328 aa		16.32	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	16.32	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	MUC3A	Q02505	3323 aa		16.32	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	PPP2R5B	Q15173	497 aa		16.32	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		16.32	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		16.32	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	SCFD2	Q8WU76	684 aa		16.32	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	16.32	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	16.32	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	16.32	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		16.32	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	16.32	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	MSRA	Q9UJ68	235 aa		16.32	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		16.32	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	RAD50	Q92878	1312 aa		16.31	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		16.31	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	PFKM	P08237	780 aa		16.31	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	PDE4D	Q08499	809 aa		16.31	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	ADGRE1	Q14246	886 aa		16.31	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	16.31	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		16.31	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	ANKS1A	Q92625	1134 aa		16.31	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	16.31	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	16.31	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	KPNA6	O60684	536 aa		16.3	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	CYP2C9	P11712	490 aa		16.3	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	16.3	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		16.3	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		16.3	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		16.3	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	RILPL2	Q969X0	211 aa		16.3	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	SCLY	Q96I15	445 aa		16.3	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468		B4DLN1	442 aa		16.29	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	PITPNM1	O00562	1244 aa		16.29	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF213	O14771	459 aa		16.29	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	MYL3	P08590	195 aa		16.29	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		16.29	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	16.29	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	NUCB1	Q02818	461 aa		16.29	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		16.29	■□□□□ 0.2
MUC1-222	ENST00000610468	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		16.29	■□□□□ 0.2

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