RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 CPXCR1Q8N123 301 aa22.64■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 TOMM22Q9NS69 142 aa22.64■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.63■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.63■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 TTLL1O95922 423 aa22.63■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 SLC4A3P48751 1232 aa22.63■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 HAND2P61296 217 aa22.63■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.63■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 Q9Y3F1 56 aa22.63■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 RIPK3Q9Y572 518 aa22.63■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 CHD7Q9P2D1 2997 aa22.62■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 F5H6K3 240 aa22.62■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 CTAGE5O15320 804 aa22.62■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 B4GALT4O60513 344 aa22.62■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 MYOGP15173 224 aa22.62■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 RFC2P35250 354 aa22.62■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 BEX3Q00994 111 aa22.62■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 KLRC3Q07444 240 aa22.62■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.61■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 ORC4O43929 436 aa22.61■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 MKL1Q969V6 931 aa22.61■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.61■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 FEM1BQ9UK73 627 aa22.61■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.61■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 PRR33A8MZF0 331 aa22.6■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 NDUFB10O96000 172 aa22.6■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 KATNBL1Q9H079 304 aa22.6■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.6■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 ACAD9Q9H845 621 aa22.6■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.6■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF213O14771 459 aa22.59■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 NEFLP07196 543 aa22.59■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 FGRP09769 529 aa22.59■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.59■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.59■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.59■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 ARNTL2Q8WYA1 636 aa22.59■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.59■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 IL25Q9H293 177 aa22.59■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 STX8Q9UNK0 236 aa22.59■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 NMT2O60551 498 aa22.58■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 CHMLP26374 656 aa22.58■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 IQSEC1Q6DN90 963 aa22.58■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 KIFC2Q96AC6 838 aa22.58■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 SCLYQ96I15 445 aa22.58■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.58■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 FGD4Q96M96 766 aa22.58■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.58■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.58■■□□□ 1.21
SGMS1-208ENST00000608287 TRANK1O15050 2925 aa22.58■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 RAD50Q92878 1312 aa22.57■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.57■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.57■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.57■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.57■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 KCNH6Q9H252 994 aa22.57■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 C11orf16Q9NQ32 467 aa22.57■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.57■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 LAMA4Q16363 1823 aa22.57■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 XIRP2A4UGR9 3374 aa22.56■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 RFXAPO00287 272 aa22.56■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 BAIAP3O94812 1187 aa22.56■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 ALADP13716 330 aa22.56■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 TTLL4Q14679 1199 aa22.56■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 TKFCQ3LXA3 575 aa22.56■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 SLFN13Q68D06 897 aa22.56■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 CERS4Q9HA82 394 aa22.56■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.56■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 ASTN1O14525 1302 aa22.56■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 GRIN2DO15399 1336 aa22.56■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 FAM86C2PA6NEL3 165 aa22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 TAP1Q03518 808 aa22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 DEFB128Q7Z7B8 93 aa22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 SKAP1Q86WV1 359 aa22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 RETREG2Q8NC44 543 aa22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 TNKSO95271 1327 aa22.55■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 PITPNM1O00562 1244 aa22.54■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.54■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 VTA1Q9NP79 307 aa22.54■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.54■■□□□ 1.2
SGMS1-208ENST00000608287 NEDD4P46934 1319 aa22.54■■□□□ 1.2
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