RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604081.1

HOXC-AS2-202, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXC-AS2, Length 2,090 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLU7O95391 586 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TDP2O95551 362 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ASIC1P78348 528 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 AOC3Q16853 763 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLFN13Q68D06 897 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM179Q6ZVK1 233 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SV2BQ7L1I2 683 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ERO1AQ96HE7 468 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 VPS16Q9H269 839 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa20.9■□□□□ 0.94
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BICDL2A1A5D9 508 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLC37A4O43826 429 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PDE4DQ08499 809 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TAB2Q9NYJ8 693 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ENTPD3O75355 529 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLC15A2Q16348 729 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UBE2SQ16763 222 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CNNM4Q6P4Q7 775 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRIM65Q6PJ69 517 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CPLX3Q8WVH0 158 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRIM47Q96LD4 638 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DNAI1Q9UI46 699 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EDIL3O43854 480 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KRT79Q5XKE5 535 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CREBRFQ8IUR6 639 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PDCL2Q8N4E4 241 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LRRC27Q9C0I9 530 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RAD21O60216 631 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CASP14P31944 242 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ICA1Q05084 483 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GRB10Q13322 594 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 COBLL1Q53SF7 1204 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 STK32BQ9NY57 414 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLX4Q8IY92 1834 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRIM49BA6NDI0 452 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM196BA6NMK8 535 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GYPCP04921 128 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC175P0C221 793 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLURP2P0DP57 97 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCNE1P24864 410 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ABCB5Q2M3G0 1257 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GRIPAP1Q4V328 841 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TTI2Q6NXR4 508 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IRF2BP1Q8IU81 584 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MARCH6O60337 910 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UBXN1Q04323 297 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SEPT2Q15019 361 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 QRICH1Q2TAL8 776 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MCTP2Q6DN12 878 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 P2RX5Q93086 422 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ATRNL1Q5VV63 1379 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PMS1P54277 932 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC93Q567U6 631 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM114A1Q8IWE2 563 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SNX29Q8TEQ0 813 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LGALS16A8MUM7 142 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PPIP5K2O43314 1243 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FECHP22830 423 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GMCL1Q96IK5 515 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PNMA5Q96PV4 448 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MYH4Q9Y623 1939 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 A0A1W2PQC6 194 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP20.84■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SIAH1Q8IUQ4 282 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMTC1Q8IUR5 882 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SOWAHDA6NJG2 315 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 F5H6K3 240 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 USP11P51784 963 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KLRC3Q07444 240 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 STK4Q13043 487 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UNC13DQ70J99 1090 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MB21D1Q8N884 522 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RAD54LQ92698 747 aa20.84■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SCN9AQ15858 1988 aa20.83■□□□□ 0.93
HOXC-AS2-202ENST00000604081 POTEMA6NI47 508 aa20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms