RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	POLR2M	P0CAP2	368 aa		10.48	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	NSMF	Q6X4W1	530 aa		10.48	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		10.48	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		10.48	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	10.48	□□□□□ -0.73	3e-9	■□□□□ 9.2
EFTUD2-223	ENST00000592576	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	ERCC3	P19447	782 aa		10.47	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATP2B1	P20020	1258 aa		10.47	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	VEGFB	P49765	207 aa		10.47	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		10.47	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		10.47	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	ACAD9	Q9H845	621 aa		10.47	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	NBR1	Q14596	966 aa		10.47	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	INF2	Q27J81	1249 aa		10.47	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	TKFC	Q3LXA3	575 aa		10.47	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		10.47	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	HSD17B4	P51659	736 aa		10.46	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	CHST13	Q8NET6	341 aa		10.46	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	USP28	Q96RU2	1077 aa		10.46	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	PORCN	Q9H237	461 aa		10.46	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	CPA4	Q9UI42	421 aa		10.46	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		10.46	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	WNT7A	O00755	349 aa		10.46	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC25A27	O95847	323 aa		10.46	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	CRHR2	Q13324	411 aa		10.46	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	10.46	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		10.46	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		10.46	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		10.46	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	TBCK	Q8TEA7	893 aa		10.46	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	COL20A1	Q9P218	1284 aa		10.46	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		10.46	□□□□□ -0.73
EFTUD2-223	ENST00000592576	TCHH	Q07283	1943 aa		10.46	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		10.46	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	TLR2	O60603	784 aa		10.46	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	GHRHR	Q02643	423 aa		10.46	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	AP3B2	Q13367	1082 aa		10.46	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		10.46	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	WDR78	Q5VTH9	848 aa		10.46	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		10.46	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANO3	Q9BYT9	981 aa		10.46	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	EFCC1	Q9HA90	598 aa		10.46	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		10.46	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		10.46	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		10.45	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		10.45	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		10.45	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		10.45	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	FBXO40	Q9UH90	709 aa		10.45	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	BCR	P11274	1271 aa		10.45	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	KRT85	P78386	507 aa		10.45	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCNA1	P78396	465 aa		10.45	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		10.45	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	CLIC4	Q9Y696	253 aa		10.45	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	FIBP	O43427	364 aa		10.45	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	CA12	O43570	354 aa		10.45	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAP2K2	P36507	400 aa		10.45	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	C17orf99	Q6UX52	265 aa		10.45	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	GBP4	Q96PP9	640 aa		10.45	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	MROH8	Q9H579	483 aa		10.45	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	EDIL3	O43854	480 aa		10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	ALDH1A1	P00352	501 aa		10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	COPB2	P35606	906 aa		10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRAPPC10	P48553	1259 aa		10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	C1QTNF8	P60827	252 aa		10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	LETM2	Q2VYF4	491 aa		10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	MCTP2	Q6DN12	878 aa		10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	NEK8	Q86SG6	692 aa		10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	CFAP45	Q9UL16	551 aa		10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	CENPF	P49454	3210 aa		10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	HSPA6	P17066	643 aa		10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	UBXN2A	P68543	259 aa		10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	TTC38	Q5R3I4	469 aa		10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANO1	Q5XXA6	986 aa		10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	ATL3	Q6DD88	541 aa		10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		10.44	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	SREBF1	P36956	1147 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARHGAP4	P98171	946 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF174	Q15697	407 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		10.43	□□□□□ -0.74
EFTUD2-223	ENST00000592576	RMDN3	Q96TC7	470 aa		10.43	□□□□□ -0.74

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms