RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 GPAMQ9HCL2 828 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 ABCB6Q9NP58 842 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 GGA1Q9UJY5 639 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 HDAC5Q9UQL6 1122 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 TLR6Q9Y2C9 796 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 LEMD3Q9Y2U8 911 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 GJA3Q9Y6H8 435 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-216ENST00000590105 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 UTYO14607 1347 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 BCRP11274 1271 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 FSTL1Q12841 308 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 MAP3K11Q16584 847 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 MTERF2Q49AM1 385 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 CIAPIN1Q6FI81 312 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 TRIM42Q8IWZ5 723 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 USP44Q9H0E7 712 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 HACL1Q9UJ83 578 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 PRR12Q9ULL5 1215 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 PPT2Q9UMR5 302 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 TAF1P21675 1872 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 CACNA1SQ13698 1873 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 RTL9Q8NET4 1388 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 XDHP47989 1333 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 F11P03951 625 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 TKFCQ3LXA3 575 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 SEZ6Q53EL9 994 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 EPHA10Q5JZY3 1008 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 KANK3Q6NY19 840 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC51AQ86UW1 340 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 PGBD3Q8N328 593 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 SMC1BQ8NDV3 1235 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 HSH2DQ96JZ2 352 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 FERD3LQ96RJ6 166 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 ST7Q9NRC1 585 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 SNED1Q8TER0 1413 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF541Q9H0D2 1346 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 ALG1L2C9J202 215 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 BCAR3O75815 825 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 UFL1O94874 794 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 HSPA6P17066 643 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 PMLP29590 882 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 TTBK2Q6IQ55 1244 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 FOXR1Q6PIV2 292 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC81Q6ZN84 652 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 PODNQ7Z5L7 613 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 SGSM3Q96HU1 749 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 KAZALD1Q96I82 304 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 SUCLG2Q96I99 432 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 LIN7BQ9HAP6 207 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 UTRNP46939 3433 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 ZBED9Q6R2W3 1325 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 RAD17O75943 681 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 MX2P20592 715 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 EPHX2P34913 555 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 MPP2Q14168 576 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 WDR44Q5JSH3 913 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 GATAD2BQ8WXI9 593 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 TCF12Q99081 682 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 DBNDD1Q9H9R9 158 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 SALL4Q9UJQ4 1053 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF804BA4D1E1 1349 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 LAMB2P55268 1798 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 YDJCA8MPS7 323 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 H7C1D1 291 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 ECE2O60344 883 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 EPS15P42566 896 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 CHRNDQ07001 517 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 LONRF2Q1L5Z9 754 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 CCNJLQ8IV13 435 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 DPF2Q92785 391 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-216ENST00000590105 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.3 ms