RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589497.5

GIPC1-210, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 5

Gene GIPC1, Length 853 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GIPC1-210ENST00000589497 COL6A1P12109 1028 aa21.9■■□□□ 1.1
GIPC1-210ENST00000589497 RXRAP19793 462 aa21.9■■□□□ 1.1
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GIPC1-210ENST00000589497 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa21.9■■□□□ 1.1
GIPC1-210ENST00000589497 FANCBQ8NB91 859 aa21.9■■□□□ 1.1
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GIPC1-210ENST00000589497 SMARCA1P28370 1054 aa21.89■■□□□ 1.09
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GIPC1-210ENST00000589497 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.89■■□□□ 1.09
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GIPC1-210ENST00000589497 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
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GIPC1-210ENST00000589497 RMDN3Q96TC7 470 aa21.87■■□□□ 1.09
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GIPC1-210ENST00000589497 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.83■■□□□ 1.09
GIPC1-210ENST00000589497 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
GIPC1-210ENST00000589497 RPS6KB1P23443 525 aa21.83■■□□□ 1.09
GIPC1-210ENST00000589497 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
GIPC1-210ENST00000589497 HSD17B4P51659 736 aa21.83■■□□□ 1.09
GIPC1-210ENST00000589497 FCHSD1Q86WN1 690 aa21.83■■□□□ 1.09
GIPC1-210ENST00000589497 KLHDC9Q8NEP7 349 aa21.83■■□□□ 1.09
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