RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 PDRG1Q9NUG6 133 aa7.89□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 PNMA2Q9UL42 364 aa7.89□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa7.89□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 LCTP09848 1927 aa7.88□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 GOLGA8AA7E2F4 631 aa7.88□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 GOLGA8BA8MQT2 603 aa7.88□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 CFBP00751 764 aa7.88□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 IGHA2P01877 340 aa7.88□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 CYBAP13498 195 aa7.88□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 SMARCA1P28370 1054 aa7.88□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 CDC27P30260 824 aa7.88□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 ADD1P35611 737 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 RPS6P62753 249 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 CCT2P78371 535 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 RTN1Q16799 776 aa7.88□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 C8orf34Q49A92 452 aa7.88□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa7.88□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 RGS22Q8NE09 1264 aa7.88□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 FGD4Q96M96 766 aa7.88□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 TAAR1Q96RJ0 339 aa7.88□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 PCDH10Q9P2E7 1040 aa7.88□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 CNPY2Q9Y2B0 182 aa7.88□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 ASB14A6NK59 587 aa7.87□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP7.87□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 TRAF1Q13077 416 aa7.87□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 STK3Q13188 491 aa7.87□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 ACVR2BQ13705 512 aa7.87□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC30A10Q6XR72 485 aa7.87□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 TMTC3Q6ZXV5 915 aa7.87□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 ARMCX2Q7L311 632 aa7.87□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 EEPD1Q7L9B9 569 aa7.87□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 MCF2L2Q86YR7 1114 aa7.87□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 SHISA4Q96DD7 197 aa7.87□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 SPZ1Q9BXG8 430 aa7.87□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa7.87□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 V9GY48 417 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 FRMPD3Q5JV73 1810 aa7.87□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 MYH7BA7E2Y1 1941 aa7.86□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 ASTN1O14525 1302 aa7.86□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa7.86□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 SEPT4O43236 478 aa7.86□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 PPFIA3O75145 1194 aa7.86□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 NEK4P51957 841 aa7.86□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 ANAPC15P60006 121 aa7.86□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 PDE4DQ08499 809 aa7.86□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC144BQ3MJ40 725 aa7.86□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 ARHGEF16Q5VV41 709 aa7.86□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 FCHSD1Q86WN1 690 aa7.86□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 FBXL16Q8N461 479 aa7.86□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 AGXT2Q9BYV1 514 aa7.86□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa7.86□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 PDGFCQ9NRA1 345 aa7.86□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 COL20A1Q9P218 1284 aa7.86□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 OGDHLQ9ULD0 1010 aa7.86□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM184BQ9ULE4 1060 aa7.86□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 CENPFP49454 3210 aa7.85□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa7.85□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 B4DLN1 442 aa7.85□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 OPLAHO14841 1288 aa7.85□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 MSCO60682 206 aa7.85□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 PGK1P00558 417 aa7.85□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 POLR2MP0CAP2 368 aa7.85□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 AKR1A1P14550 325 aa7.85□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 CAPN2P17655 700 aa7.85□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 TNFAIP2Q03169 654 aa7.85□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 FUT2Q10981 343 aa7.85□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 PPP2R5BQ15173 497 aa7.85□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM63BQ5T3F8 832 aa7.85□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 IQSEC1Q6DN90 963 aa7.85□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa7.85□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 ARRDC4Q8NCT1 418 aa7.85□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 DNERQ8NFT8 737 aa7.85□□□□□ -1.15
EFTUD2-211ENST00000588374 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 183.2 ms