RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	CYP2C19	P33261	490 aa		28.75	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	NTRK3	Q16288	839 aa		28.75	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	TBC1D5	Q92609	795 aa		28.75	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	GTF3C6	Q969F1	213 aa		28.75	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		28.74	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		28.74	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		28.74	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	SCG2	P13521	617 aa		28.73	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	28.73	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	28.73	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	CUL5	Q93034	780 aa		28.73	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	ARMC5	Q96C12	935 aa		28.73	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	28.73	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		28.72	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		28.72	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	OPLAH	O14841	1288 aa		28.72	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	DTNB	O60941	627 aa		28.72	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	POLR2M	P0CAP2	368 aa		28.72	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		28.72	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	RGS22	Q8NE09	1264 aa		28.72	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF333	Q96JL9	665 aa		28.72	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	TINF2	Q9BSI4	451 aa		28.72	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	HTT	P42858	3142 aa		28.72	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		28.71	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		28.71	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		28.71	■■■□□ 2.19
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		28.7	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	STXBP3	O00186	592 aa		28.7	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	CNGA1	P29973	690 aa		28.7	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	28.7	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	28.7	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	MTFR1	Q15390	333 aa		28.7	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	28.7	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	FGD4	Q96M96	766 aa		28.7	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	28.7	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	28.7	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	BARHL2	Q9NY43	387 aa		28.7	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		28.7	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	ASB14	A6NK59	587 aa		28.69	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	DEXI	O95424	95 aa		28.69	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	CCL5	P13501	91 aa		28.69	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	HSD17B4	P51659	736 aa		28.69	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		28.69	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	ARMCX2	Q7L311	632 aa		28.69	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	28.69	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		28.69	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		28.69	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	28.68	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	ADCY7	P51828	1080 aa		28.68	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	PKN1	Q16512	942 aa		28.68	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		28.68	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	IL27	Q8NEV9	243 aa		28.68	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		28.68	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	MAF1	Q9H063	256 aa		28.68	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	RNF208	Q9H0X6	261 aa		28.68	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	COL20A1	Q9P218	1284 aa		28.68	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	28.68	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	ASTN1	O14525	1302 aa		28.68	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		28.68	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	UBE2S	Q16763	222 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	28.67	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	RMDN3	Q96TC7	470 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	28.67	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	STK36	Q9NRP7	1315 aa		28.67	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	SMCO2	A6NFE2	343 aa		28.66	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229		B4DLN1	442 aa		28.66	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	CTDNEP1	O95476	244 aa		28.66	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	28.66	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	MCM2	P49736	904 aa		28.66	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	PDE4D	Q08499	809 aa		28.66	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		28.66	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		28.66	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		28.66	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	DNER	Q8NFT8	737 aa		28.66	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	28.66	■■■□□ 2.18	5e-6	■■□□□ 11.8
GPS1-223	ENST00000584229	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	28.66	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	RPTOR	Q8N122	1335 aa		28.66	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	CENPF	P49454	3210 aa		28.65	■■■□□ 2.18
GPS1-223	ENST00000584229	ST3GAL1	Q11201	340 aa		28.65	■■■□□ 2.18

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