RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582955.5

SMARCE1-218, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 621 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-218ENST00000582955 MCM3APO60318 1980 aa14.62□□□□□ -0.07
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SMARCE1-218ENST00000582955 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa14.57□□□□□ -0.08
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SMARCE1-218ENST00000582955 ADCY6O43306 1168 aa14.56□□□□□ -0.08
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SMARCE1-218ENST00000582955 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
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SMARCE1-218ENST00000582955 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 TM6SF1Q9BZW5 370 aa14.56□□□□□ -0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 ADAMTS4O75173 837 aa14.55□□□□□ -0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 EDNRBP24530 442 aa14.55□□□□□ -0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 CDC27P30260 824 aa14.55□□□□□ -0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 RCAN1P53805 252 aa14.55□□□□□ -0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
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