RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580814.1

TSG101-211, Transcript of tumor susceptibility 101, humanhuman

TSL 2

Gene TSG101, Length 441 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101-211ENST00000580814 LTBRP36941 435 aa8.08□□□□□ -1.12
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TSG101-211ENST00000580814 ARTNQ5T4W7 220 aa8.08□□□□□ -1.12
TSG101-211ENST00000580814 STYK1Q6J9G0 422 aa8.08□□□□□ -1.12
TSG101-211ENST00000580814 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
TSG101-211ENST00000580814 SPPL2CQ8IUH8 684 aa8.08□□□□□ -1.12
TSG101-211ENST00000580814 TP53INP2Q8IXH6 220 aa8.08□□□□□ -1.12
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TSG101-211ENST00000580814 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
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TSG101-211ENST00000580814 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
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TSG101-211ENST00000580814 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
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TSG101-211ENST00000580814 TMX1Q9H3N1 280 aa8.06□□□□□ -1.12
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TSG101-211ENST00000580814 GYS2P54840 703 aa8.05□□□□□ -1.12
TSG101-211ENST00000580814 INF2Q27J81 1249 aa8.05□□□□□ -1.12
TSG101-211ENST00000580814 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
TSG101-211ENST00000580814 TAF7LQ5H9L4 462 aa8.05□□□□□ -1.12
TSG101-211ENST00000580814 NINJ1Q92982 152 aa8.05□□□□□ -1.12
TSG101-211ENST00000580814 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
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TSG101-211ENST00000580814 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
TSG101-211ENST00000580814 C7orf72A4D263 438 aa8.04□□□□□ -1.12
TSG101-211ENST00000580814 FITM1A5D6W6 292 aa8.04□□□□□ -1.12
TSG101-211ENST00000580814 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
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TSG101-211ENST00000580814 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP8.04□□□□□ -1.122e-7■□□□□ 10.9
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TSG101-211ENST00000580814 GTF2A2P52657 109 aa8.03□□□□□ -1.12
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TSG101-211ENST00000580814 CORO7P57737 925 aa8.03□□□□□ -1.12
TSG101-211ENST00000580814 LAPTM5Q13571 262 aa8.03□□□□□ -1.12
TSG101-211ENST00000580814 ZNF792Q3KQV3 632 aa8.03□□□□□ -1.12
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TSG101-211ENST00000580814 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
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TSG101-211ENST00000580814 LCP1P13796 627 aa8.02□□□□□ -1.13
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TSG101-211ENST00000580814 SNX17Q15036 470 aa8.02□□□□□ -1.13
TSG101-211ENST00000580814 SLC14A2Q15849 920 aa8.02□□□□□ -1.13
TSG101-211ENST00000580814 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
TSG101-211ENST00000580814 LBX2Q6XYB7 198 aa8.02□□□□□ -1.13
TSG101-211ENST00000580814 ZNF662Q6ZS27 426 aa8.02□□□□□ -1.13
TSG101-211ENST00000580814 CEP128Q6ZU80 1094 aa8.02□□□□□ -1.13
TSG101-211ENST00000580814 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP8.02□□□□□ -1.134e-8■□□□□ 10.9
TSG101-211ENST00000580814 ZFP64Q9NPA5 681 aa8.02□□□□□ -1.13
TSG101-211ENST00000580814 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
TSG101-211ENST00000580814 ACSL6Q9UKU0 697 aa8.02□□□□□ -1.13
TSG101-211ENST00000580814 TRAF6Q9Y4K3 522 aa8.02□□□□□ -1.13
TSG101-211ENST00000580814 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.01□□□□□ -1.13
TSG101-211ENST00000580814 MYO1BO43795 1136 aa8.01□□□□□ -1.13
TSG101-211ENST00000580814 NIM1KQ8IY84 436 aa8.01□□□□□ -1.13
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