RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580784.5

CSNK1D-215, Transcript of casein kinase 1 delta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSNK1D, Length 1,081 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1D-215ENST00000580784 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa24.9■■□□□ 1.58
CSNK1D-215ENST00000580784 AP5M1Q9H0R1 490 aa24.9■■□□□ 1.58
CSNK1D-215ENST00000580784 CYP21A2P08686 494 aa24.89■■□□□ 1.58
CSNK1D-215ENST00000580784 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
CSNK1D-215ENST00000580784 SEC23AQ15436 765 aa24.89■■□□□ 1.58
CSNK1D-215ENST00000580784 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
CSNK1D-215ENST00000580784 C9orf50Q5SZB4 431 aa24.89■■□□□ 1.58
CSNK1D-215ENST00000580784 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
CSNK1D-215ENST00000580784 Q7L0L9 218 aa24.89■■□□□ 1.58
CSNK1D-215ENST00000580784 VAT1LQ9HCJ6 419 aa24.89■■□□□ 1.58
CSNK1D-215ENST00000580784 SGSM2O43147 1006 aa24.88■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 RAG1P15918 1043 aa24.88■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 CXCL17Q6UXB2 119 aa24.88■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 DEFB123Q8N688 67 aa24.88■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa24.87■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 ARVCFO00192 962 aa24.87■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 TRDNQ13061 729 aa24.87■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 STAG2Q8N3U4 1231 aa24.87■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 TBC1D5Q92609 795 aa24.87■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 JMJD4Q9H9V9 463 aa24.87■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 Q9Y3F1 56 aa24.87■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 TAF6LQ9Y6J9 622 aa24.87■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 QRICH1Q2TAL8 776 aa24.86■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 RGS22Q8NE09 1264 aa24.86■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 WDR11Q9BZH6 1224 aa24.86■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 MROH7Q68CQ1 1323 aa24.86■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 EPHB4P54760 987 aa24.85■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 PDE4DQ08499 809 aa24.85■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 DUSP28Q4G0W2 176 aa24.85■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 DNERQ8NFT8 737 aa24.85■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 E7EWF7 191 aa24.84■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 TBX21Q9UL17 535 aa24.84■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 ABCB11O95342 1321 aa24.84■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 KLRF2D3W0D1 207 aa24.83■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 ZEB2O60315 1214 aa24.83■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 CABYRO75952 493 aa24.83■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 EDNRBP24530 442 aa24.83■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 STOX1Q6ZVD7 989 aa24.83■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 FBXO11Q86XK2 927 aa24.83■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 FAM126BQ8IXS8 530 aa24.83■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 MAP4K1Q92918 833 aa24.83■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 MAD2L2Q9UI95 211 aa24.83■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 COL6A3P12111 3177 aa24.83■■□□□ 1.57
CSNK1D-215ENST00000580784 TIMP1P01033 207 aa24.82■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 FPGSQ05932 587 aa24.82■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 CHST3Q7LGC8 479 aa24.82■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 SLC43A3Q8NBI5 491 aa24.82■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 NCOA7Q8NI08 942 aa24.82■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 SENP2Q9HC62 589 aa24.82■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 GRIN2DO15399 1336 aa24.82■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 ITGA7Q13683 1181 aa24.81■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 TAAR1Q96RJ0 339 aa24.81■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 MTMR10Q9NXD2 777 aa24.81■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 COL20A1Q9P218 1284 aa24.81■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 B4DLN1 442 aa24.8■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 TLR3O15455 904 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 CD4P01730 458 aa24.8■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 PSMC6P62333 389 aa24.8■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 MCF2L2Q86YR7 1114 aa24.8■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 MAF1Q9H063 256 aa24.8■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 ERICH2A1L162 156 aa24.79■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 MFSD5Q6N075 450 aa24.79■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 OR6J1Q8NGC5 347 aa24.79■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 SCFD2Q8WU76 684 aa24.79■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 AMNQ9BXJ7 453 aa24.79■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 ANTXR2P58335 489 aa24.78■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 GRM4Q14833 912 aa24.78■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 WTAPQ15007 396 aa24.78■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 PPP2R5BQ15173 497 aa24.78■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 SLC35G1Q2M3R5 365 aa24.78■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 SKAP1Q86WV1 359 aa24.78■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 COPS5Q92905 334 aa24.78■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 MTMR8Q96EF0 704 aa24.78■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa24.78■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa24.77■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 ZBTB5O15062 677 aa24.77■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 TXNP10599 105 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 RMDN3Q96TC7 470 aa24.77■■□□□ 1.56
CSNK1D-215ENST00000580784 OPLAHO14841 1288 aa24.76■■□□□ 1.55
CSNK1D-215ENST00000580784 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP24.76■■□□□ 1.55
CSNK1D-215ENST00000580784 ARIH2O95376 493 aa24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms