RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568169.5

TCF4-238, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-238	ENST00000568169	GPATCH3	Q96I76	525 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	SNAP25	P60880	206 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	TTLL4	Q14679	1199 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	DCTPP1	Q9H773	170 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	MUC3A	Q02505	3323 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	TNKS	O95271	1327 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	ZBBX	A8MT70	800 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	ICAM1	P05362	532 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	CYP2C9	P11712	490 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	TFF2	Q03403	129 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	AAK1	Q2M2I8	961 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	NSMF	Q6X4W1	530 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	MIER1	Q8N108	512 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	NAPB	Q9H115	298 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	MYH6	P13533	1939 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	ERC2	O15083	957 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	NMT2	O60551	498 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	PLA2G5	P39877	138 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	NOV	P48745	357 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	STX8	Q9UNK0	236 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	TSPY2	A6NKD2	308 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	RFXAP	O00287	272 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	FOXP2	O15409	715 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	CA3	P07451	260 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	KCNQ1	P51787	676 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	SLC9A7	Q96T83	725 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	INCENP	Q9NQS7	918 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	EPOP	A6NHQ4	379 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	NFIB	O00712	420 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	MYL3	P08590	195 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	ACTN1	P12814	892 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	RFC2	P35250	354 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	CPT1A	P50416	773 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	DCAF4	Q8WV16	495 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TCF4-238	ENST00000568169	PITPNM1	O00562	1244 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-238	ENST00000568169	KPNA6	O60684	536 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-238	ENST00000568169	IQCF3	P0C7M6	154 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-238	ENST00000568169	SLC16A2	P36021	539 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-238	ENST00000568169	TAP1	Q03518	808 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-238	ENST00000568169	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-238	ENST00000568169	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-238	ENST00000568169	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-238	ENST00000568169	CCDC96	Q2M329	555 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-238	ENST00000568169	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-238	ENST00000568169	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-238	ENST00000568169	FAM122A	Q96E09	287 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-238	ENST00000568169	FSD1	Q9BTV5	496 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-238	ENST00000568169	CERS4	Q9HA82	394 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-238	ENST00000568169	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-238	ENST00000568169	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-238	ENST00000568169	COG5	Q9UP83	839 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-238	ENST00000568169	MTMR7	Q9Y216	660 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TCF4-238	ENST00000568169	SI	P14410	1827 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TCF4-238	ENST00000568169		A6NJR5	290 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TCF4-238	ENST00000568169	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	13.44	□□□□□ -0.26
TCF4-238	ENST00000568169	ORC4	O43929	436 aa		13.44	□□□□□ -0.26

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