RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 ZEB2O60315 1214 aa24.51■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM63BQ5T3F8 832 aa24.51■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 CXCL17Q6UXB2 119 aa24.51■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 RAD50Q92878 1312 aa24.51■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 TLR3O15455 904 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 CDK7P50613 346 aa24.5■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 RPS6P62753 249 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 NKX3-2P78367 333 aa24.5■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 FPGSQ05932 587 aa24.5■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 ASPRV1Q53RT3 343 aa24.5■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 MTMR10Q9NXD2 777 aa24.5■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa24.49■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 CHMLP26374 656 aa24.49■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 PDE4DQ08499 809 aa24.49■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 ADGRF4Q8IZF3 695 aa24.49■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 WDR11Q9BZH6 1224 aa24.49■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 VAT1LQ9HCJ6 419 aa24.49■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 Q9Y3F1 56 aa24.49■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 CABYRO75952 493 aa24.48■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 TIMP1P01033 207 aa24.48■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 EPHB4P54760 987 aa24.48■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 TRDNQ13061 729 aa24.48■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 TBX21Q9UL17 535 aa24.48■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 ABCB11O95342 1321 aa24.47■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 PTH1RQ03431 593 aa24.47■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 DUSP28Q4G0W2 176 aa24.47■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 CYB5R4Q7L1T6 521 aa24.47■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 FAM126BQ8IXS8 530 aa24.47■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 FAM161BQ96MY7 647 aa24.47■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 B4DLN1 442 aa24.46■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 ITGA7Q13683 1181 aa24.46■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 QRICH1Q2TAL8 776 aa24.46■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 DNERQ8NFT8 737 aa24.46■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF697Q5TEC3 545 aa24.45■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 FBXO11Q86XK2 927 aa24.45■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 OR6J1Q8NGC5 347 aa24.45■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa24.45■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa24.45■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 CYP21A2P08686 494 aa24.44■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 PSMC6P62333 389 aa24.44■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 MFSD5Q6N075 450 aa24.44■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 STAG2Q8N3U4 1231 aa24.44■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 RGS22Q8NE09 1264 aa24.44■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 TBC1D5Q92609 795 aa24.44■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 JMJD4Q9H9V9 463 aa24.44■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa24.44■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 PPP2R5BQ15173 497 aa24.43■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 SEC23AQ15436 765 aa24.43■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 MCF2L2Q86YR7 1114 aa24.43■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 SLC17A8Q8NDX2 589 aa24.43■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 ERICH2A1L162 156 aa24.42■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 CD4P01730 458 aa24.42■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 MYL3P08590 195 aa24.42■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 EDNRBP24530 442 aa24.42■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 CPT1AP50416 773 aa24.42■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP24.42■■□□□ 1.52e-6■■□□□ 11.4
PPP4C-211ENST00000567642 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM199Q8N511 208 aa24.42■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 SLC43A3Q8NBI5 491 aa24.42■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 SCFD2Q8WU76 684 aa24.42■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 POLR3EQ9NVU0 708 aa24.42■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 GRIN2DO15399 1336 aa24.41■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 KLRF2D3W0D1 207 aa24.41■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 SGSM2O43147 1006 aa24.41■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 TAAR1Q96RJ0 339 aa24.41■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 MYH7BA7E2Y1 1941 aa24.41■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP24.4■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 TXNP10599 105 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 CSF2RAP15509 400 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 CYP2C18P33260 490 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 NCOA7Q8NI08 942 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 COPS5Q92905 334 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP24.4■■□□□ 1.53e-7■■■□□ 14.8
PPP4C-211ENST00000567642 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 TRPV6Q9H1D0 765 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 MAD2L2Q9UI95 211 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP4C-211ENST00000567642 E7EWF7 191 aa24.39■■□□□ 1.49
PPP4C-211ENST00000567642 TTLL4Q14679 1199 aa24.39■■□□□ 1.49
PPP4C-211ENST00000567642 CHST3Q7LGC8 479 aa24.39■■□□□ 1.49
PPP4C-211ENST00000567642 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
PPP4C-211ENST00000567642 GUCD1Q96NT3 240 aa24.39■■□□□ 1.49
PPP4C-211ENST00000567642 AMNQ9BXJ7 453 aa24.39■■□□□ 1.49
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