RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 CALML3P27482 149 aa21.82■■□□□ 1.08
RABGGTA-208ENST00000558954 NEK4P51957 841 aa21.82■■□□□ 1.08
RABGGTA-208ENST00000558954 FUT2Q10981 343 aa21.82■■□□□ 1.08
RABGGTA-208ENST00000558954 NRBP1Q9UHY1 535 aa21.82■■□□□ 1.08
RABGGTA-208ENST00000558954 GJB1P08034 283 aa21.81■■□□□ 1.08
RABGGTA-208ENST00000558954 AK2P54819 239 aa21.81■■□□□ 1.08
RABGGTA-208ENST00000558954 SAMD3Q8N6K7 520 aa21.81■■□□□ 1.08
RABGGTA-208ENST00000558954 CNPY2Q9Y2B0 182 aa21.81■■□□□ 1.08
RABGGTA-208ENST00000558954 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa21.8■■□□□ 1.08
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RABGGTA-208ENST00000558954 OPLAHO14841 1288 aa21.8■■□□□ 1.08
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RABGGTA-208ENST00000558954 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
RABGGTA-208ENST00000558954 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
RABGGTA-208ENST00000558954 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
RABGGTA-208ENST00000558954 ASTN1O14525 1302 aa21.8■■□□□ 1.08
RABGGTA-208ENST00000558954 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa21.79■■□□□ 1.08
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RABGGTA-208ENST00000558954 hCG_1984214I3L0E3 225 aa21.79■■□□□ 1.08
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RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
RABGGTA-208ENST00000558954 DNERQ8NFT8 737 aa21.79■■□□□ 1.08
RABGGTA-208ENST00000558954 DEFB118Q96PH6 123 aa21.79■■□□□ 1.08
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RABGGTA-208ENST00000558954 CPLX1O14810 134 aa21.78■■□□□ 1.08
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RABGGTA-208ENST00000558954 GJA8P48165 433 aa21.78■■□□□ 1.08
RABGGTA-208ENST00000558954 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
RABGGTA-208ENST00000558954 HSD17B4P51659 736 aa21.78■■□□□ 1.08
RABGGTA-208ENST00000558954 TRPV1Q8NER1 839 aa21.78■■□□□ 1.08
RABGGTA-208ENST00000558954 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
RABGGTA-208ENST00000558954 BACH2Q9BYV9 841 aa21.78■■□□□ 1.08
RABGGTA-208ENST00000558954 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
RABGGTA-208ENST00000558954 B4DLN1 442 aa21.77■■□□□ 1.08
RABGGTA-208ENST00000558954 IFNAR1P17181 557 aa21.77■■□□□ 1.08
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RABGGTA-208ENST00000558954 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
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RABGGTA-208ENST00000558954 TBC1D5Q92609 795 aa21.77■■□□□ 1.08
RABGGTA-208ENST00000558954 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
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RABGGTA-208ENST00000558954 V9GY48 417 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
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RABGGTA-208ENST00000558954 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
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RABGGTA-208ENST00000558954 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
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RABGGTA-208ENST00000558954 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-208ENST00000558954 TBC1D32Q96NH3 1257 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-208ENST00000558954 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-208ENST00000558954 COL20A1Q9P218 1284 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-208ENST00000558954 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-208ENST00000558954 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
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RABGGTA-208ENST00000558954 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
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RABGGTA-208ENST00000558954 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.74■■□□□ 1.07
RABGGTA-208ENST00000558954 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa21.74■■□□□ 1.07
RABGGTA-208ENST00000558954 PIK3CDO00329 1044 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-208ENST00000558954 EN2P19622 333 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-208ENST00000558954 EDNRBP24530 442 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-208ENST00000558954 PDE4DQ08499 809 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-208ENST00000558954 SCRN1Q12765 414 aa21.73■■□□□ 1.07
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