RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557779.1

TMEM229B-208, Transcript of transmembrane protein 229B, humanhuman

TSL 2

Gene TMEM229B, Length 701 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229B-208ENST00000557779 PTGS1P23219 599 aa28.26■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 CDK7P50613 346 aa28.26■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 AP5M1Q9H0R1 490 aa28.26■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 TMEM39AQ9NV64 488 aa28.26■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 MROH7Q68CQ1 1323 aa28.25■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 TRDNQ13061 729 aa28.25■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 TMEM63BQ5T3F8 832 aa28.25■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 VTI1AQ96AJ9 217 aa28.25■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 Q9Y3F1 56 aa28.25■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa28.24■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 RGS22Q8NE09 1264 aa28.24■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 DNERQ8NFT8 737 aa28.24■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 ABCB11O95342 1321 aa28.23■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 ARVCFO00192 962 aa28.23■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 RAG1P15918 1043 aa28.23■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 EDNRBP24530 442 aa28.23■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 SHHQ15465 462 aa28.23■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 QRICH1Q2TAL8 776 aa28.23■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 C9orf50Q5SZB4 431 aa28.23■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 MAF1Q9H063 256 aa28.23■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 TBX21Q9UL17 535 aa28.23■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 TAF6LQ9Y6J9 622 aa28.23■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 DUSP28Q4G0W2 176 aa28.22■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 CXCL17Q6UXB2 119 aa28.22■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 JMJD4Q9H9V9 463 aa28.22■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 CABYRO75952 493 aa28.21■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 PDE4DQ08499 809 aa28.21■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 STAG2Q8N3U4 1231 aa28.21■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 DEFB123Q8N688 67 aa28.21■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 WDR11Q9BZH6 1224 aa28.21■■■□□ 2.11
TMEM229B-208ENST00000557779 E7EWF7 191 aa28.2■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 ZEB2O60315 1214 aa28.2■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 Q7L0L9 218 aa28.2■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 FBXO11Q86XK2 927 aa28.2■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 FAM126BQ8IXS8 530 aa28.2■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 MAP4K1Q92918 833 aa28.2■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 VAT1LQ9HCJ6 419 aa28.2■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 STOX1Q6ZVD7 989 aa28.19■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 SLC43A3Q8NBI5 491 aa28.19■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 NCOA7Q8NI08 942 aa28.19■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 MAD2L2Q9UI95 211 aa28.19■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 B4DLN1 442 aa28.18■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 KLRF2D3W0D1 207 aa28.18■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 TIMP1P01033 207 aa28.18■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 EPHB4P54760 987 aa28.18■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 FPGSQ05932 587 aa28.18■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 MCF2L2Q86YR7 1114 aa28.18■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 TBC1D5Q92609 795 aa28.18■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 TLR3O15455 904 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 MTMR8Q96EF0 704 aa28.17■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 ERICH2A1L162 156 aa28.16■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 CD4P01730 458 aa28.16■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 ITGA7Q13683 1181 aa28.16■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 PPP2R5BQ15173 497 aa28.16■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 SCFD2Q8WU76 684 aa28.16■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 SENP2Q9HC62 589 aa28.16■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 COL20A1Q9P218 1284 aa28.16■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 GRIN2DO15399 1336 aa28.16■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 GRM4Q14833 912 aa28.15■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 WTAPQ15007 396 aa28.15■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 SART3Q15020 963 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 OR6J1Q8NGC5 347 aa28.15■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 AMNQ9BXJ7 453 aa28.15■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 MTMR10Q9NXD2 777 aa28.15■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP28.14■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 ANTXR2P58335 489 aa28.14■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 MFSD5Q6N075 450 aa28.14■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 CHST3Q7LGC8 479 aa28.14■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 TAAR1Q96RJ0 339 aa28.14■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa28.14■■■□□ 2.1
TMEM229B-208ENST00000557779 ZBTB5O15062 677 aa28.13■■■□□ 2.09
TMEM229B-208ENST00000557779 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
TMEM229B-208ENST00000557779 CPT1AP50416 773 aa28.13■■■□□ 2.09
TMEM229B-208ENST00000557779 PSMC6P62333 389 aa28.13■■■□□ 2.09
TMEM229B-208ENST00000557779 SLC35G1Q2M3R5 365 aa28.13■■■□□ 2.09
TMEM229B-208ENST00000557779 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
TMEM229B-208ENST00000557779 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
TMEM229B-208ENST00000557779 POLR3EQ9NVU0 708 aa28.13■■■□□ 2.09
TMEM229B-208ENST00000557779 OPLAHO14841 1288 aa28.12■■■□□ 2.09
TMEM229B-208ENST00000557779 TROAPQ12815 778 aa28.12■■■□□ 2.09
TMEM229B-208ENST00000557779 TMEM67Q5HYA8 995 aa28.12■■■□□ 2.09
TMEM229B-208ENST00000557779 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
TMEM229B-208ENST00000557779 RMDN3Q96TC7 470 aa28.12■■■□□ 2.09
TMEM229B-208ENST00000557779 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms