RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555240.1

CASC1-208, Transcript of cancer susceptibility 1, human

TSL 5

Gene CASC1, Length 467 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASC1-208	ENST00000555240	VIPR1	P32241	457 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	CORO7	P57737	925 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	DLG4	P78352	724 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	NR1I3	Q14994	352 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	KCNA10	Q16322	511 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	DDR2	Q16832	855 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	TMC6	Q7Z403	805 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	CABP7	Q86V35	215 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	USP33	Q8TEY7	942 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	DRC1	Q96MC2	740 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	SGPP1	Q9BX95	441 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	CLEC1B	Q9P126	229 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	NPHS1	O60500	1241 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	CYBB	P04839	570 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	ITGAV	P06756	1048 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	PLS3	P13797	630 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	KCNJ6	P48051	423 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	COPS5	Q92905	334 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	EPN3	Q9H201	632 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	GULP1	Q9UBP9	304 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240		F8W031	263 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	NUAK1	O60285	661 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	KRT1	P04264	644 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	THBD	P07204	575 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	HOXC12	P31275	282 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	ECI1	P42126	302 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	IQCE	Q6IPM2	695 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	RPTN	Q6XPR3	784 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	LZTR1	Q8N653	840 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	CD320	Q9NPF0	282 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	C7orf72	A4D263	438 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	RFXAP	O00287	272 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	SRGAP3	O43295	1099 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	TBX1	O43435	398 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	KLF4	O43474	513 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	DBH	P09172	617 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	MAPKAPK2	P49137	400 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	LINC00310	P59036	64 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	RAB33A	Q14088	237 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	ZNF385B	Q569K4	471 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	CCDC140	Q96MF4	163 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	MMP19	Q99542	508 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	BTG4	Q9NY30	223 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	IRAK3	Q9Y616	596 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	N4BP3	O15049	544 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	MYO1B	O43795	1136 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	CP	P00450	1065 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	FUCA1	P04066	466 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	CFP	P27918	469 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	EPHB3	P54753	998 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	LDHD	Q86WU2	507 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	FRS2	Q8WU20	508 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	MZB1	Q8WU39	189 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	GCM1	Q9NP62	436 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	KCTD3	Q9Y597	815 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CASC1-208	ENST00000555240	GLI4	P10075	376 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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