RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 GABBR1Q9UBS5 961 aa6.92□□□□□ -1.3
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PTPRB-210ENST00000551525 SYNE4Q8N205 404 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 CARD14Q9BXL6 1004 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
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PTPRB-210ENST00000551525 CHAMP1Q96JM3 812 aa6.92□□□□□ -1.3
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PTPRB-210ENST00000551525 NXNQ6DKJ4 435 aa6.91□□□□□ -1.3
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PTPRB-210ENST00000551525 STX12Q86Y82 276 aa6.91□□□□□ -1.3
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PTPRB-210ENST00000551525 COQ7Q99807 217 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 ZNRF3Q9ULT6 936 aa6.91□□□□□ -1.3
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