RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 NUP133Q8WUM0 1156 aa24.29■■□□□ 1.48
CS-222ENST00000550996 TMEM87BQ96K49 555 aa24.29■■□□□ 1.48
CS-222ENST00000550996 PIGSQ96S52 555 aa24.29■■□□□ 1.48
CS-222ENST00000550996 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
CS-222ENST00000550996 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
CS-222ENST00000550996 ZBTB5O15062 677 aa24.28■■□□□ 1.48
CS-222ENST00000550996 DDAH1O94760 285 aa24.28■■□□□ 1.48
CS-222ENST00000550996 SYN1P17600 705 aa24.28■■□□□ 1.48
CS-222ENST00000550996 EDNRBP24530 442 aa24.28■■□□□ 1.48
CS-222ENST00000550996 TSGA10IPQ3SY00 556 aa24.28■■□□□ 1.48
CS-222ENST00000550996 RNF20Q5VTR2 975 aa24.28■■□□□ 1.48
CS-222ENST00000550996 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa24.28■■□□□ 1.48
CS-222ENST00000550996 HOMER1Q86YM7 354 aa24.28■■□□□ 1.48
CS-222ENST00000550996 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CS-222ENST00000550996 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
CS-222ENST00000550996 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
CS-222ENST00000550996 SMPD1P17405 629 aa24.27■■□□□ 1.48
CS-222ENST00000550996 RXRAP19793 462 aa24.27■■□□□ 1.48
CS-222ENST00000550996 RTP1P59025 263 aa24.27■■□□□ 1.48
CS-222ENST00000550996 SNX17Q15036 470 aa24.27■■□□□ 1.48
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CS-222ENST00000550996 KCNB2Q92953 911 aa24.27■■□□□ 1.48
CS-222ENST00000550996 TCEANC2Q96MN5 208 aa24.27■■□□□ 1.48
CS-222ENST00000550996 AMNQ9BXJ7 453 aa24.27■■□□□ 1.48
CS-222ENST00000550996 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
CS-222ENST00000550996 CST5P28325 142 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 LIFRP42702 1097 aa24.26■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 GJA9P57773 515 aa24.26■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 TNFAIP2Q03169 654 aa24.26■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa24.26■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 NEK1Q96PY6 1258 aa24.26■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 MAP3K14Q99558 947 aa24.26■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 VTA1Q9NP79 307 aa24.26■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa24.25■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 A0A1W2PQY0 241 aa24.25■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 PLEKHA8P1O95397 391 aa24.25■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 NKX3-2P78367 333 aa24.25■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 KCNA10Q16322 511 aa24.25■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 NFXL1Q6ZNB6 911 aa24.25■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 DNERQ8NFT8 737 aa24.25■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 TAAR1Q96RJ0 339 aa24.25■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
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CS-222ENST00000550996 GHRHRQ02643 423 aa24.24■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 TRIM60Q495X7 471 aa24.24■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 SGMS1Q86VZ5 419 aa24.24■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 PIBF1Q8WXW3 757 aa24.24■■□□□ 1.47
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CS-222ENST00000550996 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa24.24■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa24.24■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa24.23■■□□□ 1.47
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CS-222ENST00000550996 MCF2L2Q86YR7 1114 aa24.23■■□□□ 1.47
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CS-222ENST00000550996 C1orf53Q5VUE5 145 aa24.22■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 IQSEC1Q6DN90 963 aa24.22■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 GDF15Q99988 308 aa24.22■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 SNX14Q9Y5W7 946 aa24.22■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 MOXD2PA6NHM9 499 aa24.21■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 CFBP00751 764 aa24.21■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 KIF5BP33176 963 aa24.21■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 GNASQ5JWF2 1037 aa24.21■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 BRPF3Q9ULD4 1205 aa24.21■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 SLC12A7Q9Y666 1083 aa24.21■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 SZT2Q5T011 3432 aa24.21■■□□□ 1.47
CS-222ENST00000550996 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
CS-222ENST00000550996 ASGR1P07306 291 aa24.2■■□□□ 1.46
CS-222ENST00000550996 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
CS-222ENST00000550996 TLE2Q04725 743 aa24.2■■□□□ 1.46
CS-222ENST00000550996 KRT32Q14532 448 aa24.2■■□□□ 1.46
CS-222ENST00000550996 DUSP28Q4G0W2 176 aa24.2■■□□□ 1.46
CS-222ENST00000550996 MICU3Q86XE3 530 aa24.2■■□□□ 1.46
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CS-222ENST00000550996 WDR11Q9BZH6 1224 aa24.2■■□□□ 1.46
CS-222ENST00000550996 SPC25Q9HBM1 224 aa24.2■■□□□ 1.46
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CS-222ENST00000550996 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
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CS-222ENST00000550996 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CS-222ENST00000550996 REC8O95072 547 aa24.18■■□□□ 1.46
CS-222ENST00000550996 ARIH2O95376 493 aa24.18■■□□□ 1.46
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