RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550352.1

GNPTAB-207, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTAB, Length 787 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-207ENST00000550352 INF2Q27J81 1249 aa7.31□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 NSMFQ6X4W1 530 aa7.31□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 PPIL6Q8IXY8 311 aa7.31□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 ASIC4Q96FT7 647 aa7.31□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 MMP19Q99542 508 aa7.31□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 ACSL6Q9UKU0 697 aa7.31□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 A0A1W2PQ27 194 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 A0A1W2PQ64 194 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 A0A1W2PQC6 194 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 A0A1W2PQD8 194 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 BLACEA4D250 179 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 C7orf72A4D263 438 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 MVKQ03426 396 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 FAM209AQ5JX71 171 aa7.3□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 PNLIPP16233 465 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 SDHBP21912 280 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 CYP4F8P98187 520 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 MPZL3Q6UWV2 235 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 DIO2Q92813 273 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 CDC6Q99741 560 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 CRTAC1Q9NQ79 661 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 GULP1Q9UBP9 304 aa7.29□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 NPHS1O60500 1241 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 LCP1P13796 627 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 TACR1P25103 407 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 NTRK3Q16288 839 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 IQCEQ6IPM2 695 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 USP53Q70EK8 1073 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 JMYQ8N9B5 988 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 NLGN2Q8NFZ4 835 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 EXOC2Q96KP1 924 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 RWDD3Q9Y3V2 267 aa7.28□□□□□ -1.24
GNPTAB-207ENST00000550352 LTBRP36941 435 aa7.27□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 CORO7P57737 925 aa7.27□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 KCNAB2Q13303 367 aa7.27□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 TESK1Q15569 626 aa7.27□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 LONRF2Q1L5Z9 754 aa7.27□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 C2orf27AQ580R0 203 aa7.27□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 ADGRF1Q5T601 910 aa7.27□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 PRR23BQ6ZRT6 265 aa7.27□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 SCUBE1Q8IWY4 988 aa7.27□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 RCBTB1Q8NDN9 531 aa7.27□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 DPF3Q92784 378 aa7.27□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 SLC6A17Q9H1V8 727 aa7.27□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 KANSL2Q9H9L4 492 aa7.27□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 PDLIM7Q9NR12 457 aa7.27□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 FBLN5Q9UBX5 448 aa7.27□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 PDE6BP35913 854 aa7.26□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 ARL4AP40617 200 aa7.26□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
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GNPTAB-207ENST00000550352 KCNK12Q9HB15 430 aa7.26□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 BTG4Q9NY30 223 aa7.26□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa7.26□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa7.26□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 A0A1W2PQJ5 194 aa7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 MLANAQ16655 118 aa7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 KCNT2Q6UVM3 1135 aa7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 LZTR1Q8N653 840 aa7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 SH3TC2Q8TF17 1288 aa7.25□□□□□ -1.25
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GNPTAB-207ENST00000550352 SLC26A8Q96RN1 970 aa7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 DIRC2Q96SL1 478 aa7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 MTA3Q9BTC8 594 aa7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 PHF20Q9BVI0 1012 aa7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 MARCH2Q9P0N8 246 aa7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 FBXL7Q9UJT9 491 aa7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 LRRC10BA6NIK2 292 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 MSCO60682 206 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 FUCA1P04066 466 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 BCL6P41182 706 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 ERVFRD-1P60508 538 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 SQSTM1Q13501 440 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 BICRALQ6AI39 1079 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 IRF2BP1Q8IU81 584 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 TEX2Q8IWB9 1127 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 DCAF4Q8WV16 495 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 FAM53CQ9NYF3 392 aa7.24□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 OR14I1A6ND48 311 aa7.23□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 NUDT19A8MXV4 375 aa7.23□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
GNPTAB-207ENST00000550352 PLEKHO2Q8TD55 490 aa7.23□□□□□ -1.25
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