RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 NOSTRINQ8IVI9 506 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 CUL5Q93034 780 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 TRERF1Q96PN7 1200 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 EFCC1Q9HA90 598 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 C6orf50Q9HD87 102 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 MORF4L1Q9UBU8 362 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 CPA4Q9UI42 421 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 LCTP09848 1927 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
CS-216ENST00000549221 MYH15Q9Y2K3 1946 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 PIK3CDO00329 1044 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 CFBP00751 764 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 ERCC3P19447 782 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 GNA11P29992 359 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 INHBEP58166 350 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP9.33□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 INF2Q27J81 1249 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 MYSM1Q5VVJ2 828 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 GALNT17Q6IS24 598 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 ACAD9Q9H845 621 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 ASTN1O14525 1302 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 CA12O43570 354 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 TLR2O60603 784 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 POLR2MP0CAP2 368 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 RPS6P62753 249 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 CAP1Q01518 475 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 TRAF1Q13077 416 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 FAM110CQ1W6H9 321 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 TKFCQ3LXA3 575 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 C17orf99Q6UX52 265 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 NSMFQ6X4W1 530 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 BRAPQ7Z569 592 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 FCHSD1Q86WN1 690 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 NCAPG2Q86XI2 1143 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 IL31RAQ8NI17 732 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 CRYGNQ8WXF5 182 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 FGD4Q96M96 766 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 USP28Q96RU2 1077 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 ANO3Q9BYT9 981 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 GDPD2Q9HCC8 539 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 BRMS1Q9HCU9 246 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 CYP39A1Q9NYL5 469 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 CNPY2Q9Y2B0 182 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 CLIC4Q9Y696 253 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 BAG4O95429 457 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 ATP2B1P20020 1258 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 CTGFP29279 349 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 UBXN2AP68543 259 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 CNTN2Q02246 1040 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP9.31□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 RNF207Q6ZRF8 634 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP9.31□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 KRT25Q7Z3Z0 450 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 SHCBP1Q8NEM2 672 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 CHST13Q8NET6 341 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 BICD2Q8TD16 824 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 TBCKQ8TEA7 893 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 TAAR1Q96RJ0 339 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 PNMA2Q9UL42 364 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 MRVI1Q9Y6F6 885 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 CUL9Q8IWT3 2517 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 MYH7BA7E2Y1 1941 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 FRMPD4Q14CM0 1322 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 RPTORQ8N122 1335 aa9.31□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 FIBPO43427 364 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 TDP2O95551 362 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 TBC1D8O95759 1140 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 SLC25A27O95847 323 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 PGK2P07205 417 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 MAP2K2P36507 400 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 SREBF1P36956 1147 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 ARHGAP4P98171 946 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CS-216ENST00000549221 AP3B2Q13367 1082 aa9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms