RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548746.5

CS-213, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-213ENST00000548746 DNERQ8NFT8 737 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 NUP133Q8WUM0 1156 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 BRF1Q92994 677 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 DDX11Q96FC9 970 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 MYL10Q9BUA6 226 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 TMEM106CQ9BVX2 250 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 RNF208Q9H0X6 261 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 HOMER2Q9NSB8 354 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 ALPK3Q96L96 1907 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 SOWAHBA6NEL2 793 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 ASB14A6NK59 587 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 hCG_1984214I3L0E3 225 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 PIK3CDO00329 1044 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 RXRAP19793 462 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 RBM25P49756 843 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 RPS6P62753 249 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 CNTN2Q02246 1040 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 SLC30A10Q6XR72 485 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 ARMCX2Q7L311 632 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 MCF2L2Q86YR7 1114 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 IL27Q8NEV9 243 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 PIGSQ96S52 555 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 GOLGA8AA7E2F4 631 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 GOLGA8BA8MQT2 603 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 PRR29P0C7W0 189 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 AKR1A1P14550 325 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 EN2P19622 333 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 CDC27P30260 824 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.318e-8■■■■■ 32.5
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CS-213ENST00000548746 ACVR2BQ13705 512 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 NTRK3Q16288 839 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 USH1GQ495M9 461 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 PPP1R18Q6NYC8 613 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 NSMFQ6X4W1 530 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 HOMER1Q86YM7 354 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 DEFB118Q96PH6 123 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 KIF2CQ99661 725 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 VAT1LQ9HCJ6 419 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 VTA1Q9NP79 307 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 COL20A1Q9P218 1284 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 CNPY2Q9Y2B0 182 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-213ENST00000548746 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CS-213ENST00000548746 ESYT2A0FGR8 921 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-213ENST00000548746 PTPDC1A2A3K4 754 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-213ENST00000548746 DNM1LO00429 736 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-213ENST00000548746 MEIS2O14770 477 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-213ENST00000548746 ADAMTS4O75173 837 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-213ENST00000548746 COL6A1P12109 1028 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-213ENST00000548746 IFNAR1P17181 557 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-213ENST00000548746 CST5P28325 142 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CS-213ENST00000548746 SLC4A3P48751 1232 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-213ENST00000548746 FGD1P98174 961 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-213ENST00000548746 ANKRD1Q15327 319 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-213ENST00000548746 CHRDL2Q6WN34 429 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-213ENST00000548746 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-213ENST00000548746 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CS-213ENST00000548746 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CS-213ENST00000548746 TBC1D5Q92609 795 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-213ENST00000548746 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CS-213ENST00000548746 IWS1Q96ST2 819 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-213ENST00000548746 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CS-213ENST00000548746 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CS-213ENST00000548746 PDRG1Q9NUG6 133 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-213ENST00000548746 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CS-213ENST00000548746 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CS-213ENST00000548746 Q9Y3F1 56 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-213ENST00000548746 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-213ENST00000548746 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-213ENST00000548746 STK36Q9NRP7 1315 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-213ENST00000548746 CEP290O15078 2479 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-213ENST00000548746 B4DLN1 442 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-213ENST00000548746 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
CS-213ENST00000548746 STXBP3O00186 592 aa6.82□□□□□ -1.32
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