RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-208	ENST00000547298	NYAP2	Q9P242	653 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	CACNA1A	O00555	2505 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	CXCL10	P02778	98 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	MYL3	P08590	195 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	RNF135	Q8IUD6	432 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	C5orf42	Q9H799	3197 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	NBN	O60934	754 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	CHGB	P05060	677 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	BFSP2	Q13515	415 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	CTR9	Q6PD62	1173 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	VTA1	Q9NP79	307 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	FEM1B	Q9UK73	627 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	COG6	Q9Y2V7	657 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	TMEM221	A6NGB7	291 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298		M0R296	226 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	MBD4	O95243	580 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	TRIM27	P14373	513 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	BANK1	Q8NDB2	785 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	PRRX2	Q99811	253 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	RNF146	Q9NTX7	359 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		13.54	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	LCT	P09848	1927 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	RASA1	P20936	1047 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	CPT1A	P50416	773 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	RBL2	Q08999	1139 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	MKL1	Q969V6	931 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	FAM50B	Q9Y247	325 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		13.52	□□□□□ -0.24
CS-208	ENST00000547298	MBTPS2	O43462	519 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-208	ENST00000547298	SELP	P16109	830 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-208	ENST00000547298	ADD2	P35612	726 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-208	ENST00000547298	EPC2	Q52LR7	807 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-208	ENST00000547298	CAGE1	Q8TC20	777 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-208	ENST00000547298	CLDND1	Q9NY35	253 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-208	ENST00000547298	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-208	ENST00000547298	PLXNA3	P51805	1871 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-208	ENST00000547298	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-208	ENST00000547298	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CS-208	ENST00000547298		A6NJR5	290 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-208	ENST00000547298		H3BNC9	293 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-208	ENST00000547298	GOLIM4	O00461	696 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-208	ENST00000547298	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CS-208	ENST00000547298	PTGIS	Q16647	500 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-208	ENST00000547298	PTPRO	Q16827	1216 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-208	ENST00000547298	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CS-208	ENST00000547298	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-208	ENST00000547298	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-208	ENST00000547298	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-208	ENST00000547298	RPAIN	Q86UA6	219 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-208	ENST00000547298	AACS	Q86V21	672 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-208	ENST00000547298	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CS-208	ENST00000547298	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-208	ENST00000547298	COPS5	Q92905	334 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-208	ENST00000547298	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CS-208	ENST00000547298	INSL6	Q9Y581	213 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-208	ENST00000547298	PROB1	E7EW31	1015 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-208	ENST00000547298	FDX1	P10109	184 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-208	ENST00000547298	CKB	P12277	381 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-208	ENST00000547298	MBTPS1	Q14703	1052 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-208	ENST00000547298	CLUL1	Q15846	466 aa		13.5	□□□□□ -0.25

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