RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547216.1

ARHGAP9-208, Transcript of Rho GTPase activating protein 9, human

TSL 4

Gene ARHGAP9, Length 587 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARHGAP9-208	ENST00000547216	FBXO40	Q9UH90	709 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		13.92	□□□□□ -0.18
ARHGAP9-208	ENST00000547216	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ZNF536	O15090	1300 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SLC25A27	O95847	323 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SOX10	P56693	466 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARHGAP9-208	ENST00000547216	KIF22	Q14807	665 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARHGAP9-208	ENST00000547216	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARHGAP9-208	ENST00000547216	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARHGAP9-208	ENST00000547216	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARHGAP9-208	ENST00000547216	REPS2	Q8NFH8	660 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARHGAP9-208	ENST00000547216	MAF1	Q9H063	256 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ACAD9	Q9H845	621 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARHGAP9-208	ENST00000547216	RNF146	Q9NTX7	359 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ARHGAP9-208	ENST00000547216	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
ARHGAP9-208	ENST00000547216	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ARHGAP9-208	ENST00000547216	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
ARHGAP9-208	ENST00000547216	POLR2M	P0CAP2	368 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ARHGAP9-208	ENST00000547216	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	13.9	□□□□□ -0.18
ARHGAP9-208	ENST00000547216	AP3B2	Q13367	1082 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ARHGAP9-208	ENST00000547216	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CHST13	Q8NET6	341 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ARHGAP9-208	ENST00000547216	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ARHGAP9-208	ENST00000547216	GBP4	Q96PP9	640 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ARHGAP9-208	ENST00000547216	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
ARHGAP9-208	ENST00000547216	GABRQ	Q9UN88	632 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ARHGAP9-208	ENST00000547216	BTBD18	B2RXH4	712 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PIK3CD	O00329	1044 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CFB	P00751	764 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ERVK-9	P63128	1117 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ERVK-24	P63145	666 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	REST	Q13127	1097 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ARHGEF6	Q15052	776 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	MROH8	Q9H579	483 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	BTBD7	Q9P203	1132 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PFAS	O15067	1338 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	NR5A1	Q13285	461 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	13.88	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216		Q3C1V9	767 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	NSMF	Q6X4W1	530 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	OXER1	Q8TDS5	423 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SHISA4	Q96DD7	197 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	SRRD	Q9UH36	339 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	HTT	P42858	3142 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	KIF28P	B7ZC32	967 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	NFIB	O00712	420 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TRAPPC10	P48553	1259 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	FCGRT	P55899	365 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	KRT85	P78386	507 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PRKCZ	Q05513	592 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	NPY5R	Q15761	445 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	UBE2S	Q16763	222 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	WDR78	Q5VTH9	848 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ATL3	Q6DD88	541 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CFAP45	Q9UL16	551 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	CNMD	O75829	334 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	GNRH1	P01148	92 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	ERCC3	P19447	782 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	RGS19	P49795	217 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	HSD17B4	P51659	736 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	GHRHR	Q02643	423 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	KCTD2	Q14681	263 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ARHGAP9-208	ENST00000547216	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		13.86	□□□□□ -0.19

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