RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544244.5

PTPRO-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRO, Length 3,978 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-210ENST00000544244 ACAD9Q9H845 621 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 FAM13BQ9NYF5 915 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 CTDNEP1O95476 244 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 BRD1O95696 1058 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 ICAM1P05362 532 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 NTRK3Q16288 839 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 LETM2Q2VYF4 491 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 ARHGEF16Q5VV41 709 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 KCNH4Q9UQ05 1017 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 NAV1Q8NEY1 1877 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 KIF3CO14782 793 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 APLP1P51693 650 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 OAZ1P54368 228 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 HERVK_113P62684 666 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 AP3B2Q13367 1082 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 RNF207Q6ZRF8 634 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 ANKRD23Q86SG2 305 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 CHST13Q8NET6 341 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 TTC38Q5R3I4 469 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 DPP9Q86TI2 863 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 NKX2-3Q8TAU0 364 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 TLL2Q9Y6L7 1015 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 MYH1P12882 1939 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 VWA5AO00534 786 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 NOVP48745 357 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF174Q15697 407 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 NLRX1Q86UT6 975 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 TEX2Q8IWB9 1127 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 SAMD3Q8N6K7 520 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 KCNG4Q8TDN1 519 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 KIF12Q96FN5 646 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 RIC8AQ9NPQ8 531 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 ESYT2A0FGR8 921 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 STXBP3O00186 592 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 FCER1AP12319 257 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 FDPSP14324 419 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 MCM7P33993 719 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 TRAPPC10P48553 1259 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 NEK8Q86SG6 692 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 NBPF11Q86T75 865 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 CAPNS2Q96L46 248 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 AGBL1Q96MI9 1066 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 UBE2SQ16763 222 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 INF2Q27J81 1249 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 MYSM1Q5VVJ2 828 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 ANO1Q5XXA6 986 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 RASGRP2Q7LDG7 609 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 SAPCD2Q86UD0 394 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 MMP19Q99542 508 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 POM121CA8CG34 1229 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 MBD3O95983 291 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 GNPTABQ3T906 1256 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 CYP4F22Q6NT55 531 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 ANO3Q9BYT9 981 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 MROH8Q9H579 483 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 PCDHA6Q9UN73 950 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 BTBD19C9JJ37 291 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 SPTLC2O15270 562 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 CYTH3O43739 400 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 HOXD10P28358 340 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 TREML2Q5T2D2 321 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 CST9Q5W186 159 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 RASAL3Q86YV0 1011 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 ERMNQ8TAM6 284 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 RASGRP4Q8TDF6 673 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 SPATC1LQ9H0A9 340 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRO-210ENST00000544244 ZMYND12Q9H0C1 365 aa6.43□□□□□ -1.38
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