RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534219.5

PTPRJ-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRJ, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-206ENST00000534219 PTGS1P23219 599 aa29.13■■■□□ 2.25
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PTPRJ-206ENST00000534219 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
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PTPRJ-206ENST00000534219 ZEB2O60315 1214 aa29.12■■■□□ 2.25
PTPRJ-206ENST00000534219 ITGB8P26012 769 aa29.12■■■□□ 2.25
PTPRJ-206ENST00000534219 NKX3-2P78367 333 aa29.12■■■□□ 2.25
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PTPRJ-206ENST00000534219 TMEM63BQ5T3F8 832 aa29.12■■■□□ 2.25
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PTPRJ-206ENST00000534219 DUSP28Q4G0W2 176 aa29.08■■■□□ 2.25
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PTPRJ-206ENST00000534219 TAF6LQ9Y6J9 622 aa29.08■■■□□ 2.25
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PTPRJ-206ENST00000534219 OR6J1Q8NGC5 347 aa29.04■■■□□ 2.24
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PTPRJ-206ENST00000534219 AMNQ9BXJ7 453 aa29.04■■■□□ 2.24
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PTPRJ-206ENST00000534219 TMEM67Q5HYA8 995 aa29.03■■■□□ 2.24
PTPRJ-206ENST00000534219 SENP2Q9HC62 589 aa29.03■■■□□ 2.24
PTPRJ-206ENST00000534219 LCTP09848 1927 aa29.02■■■□□ 2.24
PTPRJ-206ENST00000534219 CFBP00751 764 aa29.02■■■□□ 2.24
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PTPRJ-206ENST00000534219 PSMC6P62333 389 aa29.02■■■□□ 2.24
PTPRJ-206ENST00000534219 HOMER1Q86YM7 354 aa29.02■■■□□ 2.24
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PTPRJ-206ENST00000534219 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.24
PTPRJ-206ENST00000534219 ZBTB5O15062 677 aa29.01■■■□□ 2.23
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PTPRJ-206ENST00000534219 MYL3P08590 195 aa29.01■■■□□ 2.23
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PTPRJ-206ENST00000534219 GRM4Q14833 912 aa29.01■■■□□ 2.23
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PTPRJ-206ENST00000534219 SLC43A3Q8NBI5 491 aa29.01■■■□□ 2.23
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PTPRJ-206ENST00000534219 POLR3EQ9NVU0 708 aa29.01■■■□□ 2.23
PTPRJ-206ENST00000534219 COL20A1Q9P218 1284 aa29.01■■■□□ 2.23
PTPRJ-206ENST00000534219 ARHGEF16Q5VV41 709 aa29■■■□□ 2.23
PTPRJ-206ENST00000534219 MFSD5Q6N075 450 aa29■■■□□ 2.23
PTPRJ-206ENST00000534219 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
PTPRJ-206ENST00000534219 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa29■■■□□ 2.23
PTPRJ-206ENST00000534219 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa29■■■□□ 2.23
PTPRJ-206ENST00000534219 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa29■■■□□ 2.23
PTPRJ-206ENST00000534219 GRIN2DO15399 1336 aa28.99■■■□□ 2.23
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