RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531500.5

RBM25-209, Transcript of RNA binding motif protein 25, human

TSL 3

Gene RBM25, Length 1,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM25-209	ENST00000531500	MSC	O60682	206 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	IGHA2	P01877	340 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	CYBA	P13498	195 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	CAPN2	P17655	700 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	NEK4	P51957	841 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	EVC	P57679	992 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	ARMCX2	Q7L311	632 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	CPLX1	O14810	134 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	SEPT4	O43236	478 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	POLR2M	P0CAP2	368 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	STK3	Q13188	491 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	ACVR2B	Q13705	512 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	TRPV1	Q8NER1	839 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	DNER	Q8NFT8	737 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	CUL5	Q93034	780 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	IL17RA	Q96F46	866 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	FGD4	Q96M96	766 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	AKR1A1	P14550	325 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	AK2	P54819	239 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	PDE4D	Q08499	809 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	RARB	P10826	455 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	RGS19	P49795	217 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	HSD17B4	P51659	736 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	FUT2	Q10981	343 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	ANO1	Q5XXA6	986 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	LHX8	Q68G74	356 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	RMDN3	Q96TC7	470 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		12.8	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	OPLAH	O14841	1288 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	NAPA	P54920	295 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	12.79	□□□□□ -0.36	1e-6	■□□□□ 11.3
RBM25-209	ENST00000531500	PHKB	Q93100	1093 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	SHISA4	Q96DD7	197 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	IWS1	Q96ST2	819 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	COL20A1	Q9P218	1284 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	ASTN1	O14525	1302 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	NID2	Q14112	1375 aa		12.79	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	PPFIA3	O75145	1194 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	CDKL5	O76039	1030 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	SCG2	P13521	617 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	IFNAR1	P17181	557 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	GHRHR	Q02643	423 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	STXBP2	Q15833	593 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	NTRK3	Q16288	839 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		12.78	□□□□□ -0.36
RBM25-209	ENST00000531500	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		12.78	□□□□□ -0.36

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