RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa8.33□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 EPHX1P07099 455 aa8.32□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 GLI4P10075 376 aa8.32□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 NCAM1P13591 858 aa8.32□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 KCNC1P48547 511 aa8.32□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 SEPHS1P49903 392 aa8.32□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 FRMD5Q7Z6J6 570 aa8.32□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 RASGRP4Q8TDF6 673 aa8.32□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 FNIP1Q8TF40 1166 aa8.32□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 ALG3Q92685 438 aa8.32□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 ADAM7Q9H2U9 754 aa8.32□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 PCDHB10Q9UN67 800 aa8.32□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.32□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 BACE2Q9Y5Z0 518 aa8.32□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 A0A1W2PQH9 124 aa8.31□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 ATF2P15336 505 aa8.31□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 RBM10P98175 930 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 AMPD2Q01433 879 aa8.31□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 GRB10Q13322 594 aa8.31□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 DPY19L1Q2PZI1 675 aa8.31□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 VWA3BQ502W6 1294 aa8.31□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 LZTR1Q8N653 840 aa8.31□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 FGD4Q96M96 766 aa8.31□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 NUDT5Q9UKK9 219 aa8.31□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 VAMP4O75379 141 aa8.3□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 ASGR2P07307 311 aa8.3□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 SLURP1P55000 103 aa8.3□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 NETO2Q8NC67 525 aa8.3□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa8.3□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 RWDD3Q9Y3V2 267 aa8.3□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa8.29□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 C2orf71A6NGG8 1288 aa8.29□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 PPP2R5EQ16537 467 aa8.29□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa8.29□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 KLHL6Q8WZ60 621 aa8.29□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 TSPAN17Q96FV3 270 aa8.29□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 PEX11GQ96HA9 241 aa8.29□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 PAMP19021 973 aa8.28□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 MC3RP41968 323 aa8.28□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 HTRA3P83110 453 aa8.28□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 LIPIQ6XZB0 460 aa8.28□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 SAPCD2Q86UD0 394 aa8.28□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 RXFP1Q9HBX9 757 aa8.28□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
SGCE-211ENST00000522045 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa8.27□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 PMLP29590 882 aa8.27□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 GJA8P48165 433 aa8.27□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 SLC9A5Q14940 896 aa8.27□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa8.27□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 CPLX3Q8WVH0 158 aa8.27□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa8.27□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 FBLN5Q9UBX5 448 aa8.27□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 NASPP49321 788 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 NT5DC4Q86YG4 428 aa8.26□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 CPNE8Q86YQ8 564 aa8.26□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa8.26□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 USP33Q8TEY7 942 aa8.26□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 SHDQ96IW2 340 aa8.26□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 SPATA25Q9BR10 227 aa8.26□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 USP40Q9NVE5 1235 aa8.26□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 GULP1Q9UBP9 304 aa8.26□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 A0A1B0GTL3 188 aa8.25□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 SH3D21A4FU49 640 aa8.25□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 ANKRD34BA5PLL1 514 aa8.25□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 ZBTB7AO95365 584 aa8.25□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 CASP7P55210 303 aa8.25□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 WWC2Q6AWC2 1192 aa8.25□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 KIAA1211LQ6NV74 962 aa8.25□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 VHLLQ6RSH7 139 aa8.25□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 DBX2Q6ZNG2 339 aa8.25□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 MTA3Q9BTC8 594 aa8.25□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 BDH2Q9BUT1 245 aa8.25□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 BCAS3Q9H6U6 928 aa8.25□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 NPHS1O60500 1241 aa8.24□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 PLP2Q04941 152 aa8.24□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 NT5DC1Q5TFE4 455 aa8.24□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 CPA5Q8WXQ8 436 aa8.24□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP8.24□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 AKT3Q9Y243 479 aa8.24□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 RTP5Q14D33 572 aa8.23□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa8.23□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa8.23□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 SEC16BQ96JE7 1060 aa8.23□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 C7orf72A4D263 438 aa8.22□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 ADRB1P08588 477 aa8.22□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 NAT2P11245 290 aa8.22□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
SGCE-211ENST00000522045 UBXN11Q5T124 520 aa8.22□□□□□ -1.09
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