RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa11.26□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 ZEB2O60315 1214 aa11.26□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 AP1G2O75843 785 aa11.26□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 CACNB3P54284 484 aa11.26□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 RBL2Q08999 1139 aa11.26□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF541Q9H0D2 1346 aa11.26□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 PARD3BQ8TEW8 1205 aa11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 ARL8AQ96BM9 186 aa11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 UBAC1Q9BSL1 405 aa11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 ADD2P35612 726 aa11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 SYKP43405 635 aa11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 HAND2P61296 217 aa11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 PPARDQ03181 441 aa11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 SH2D3CQ8N5H7 860 aa11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 KCNG4Q8TDN1 519 aa11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 CAPZA3Q96KX2 299 aa11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 SCLT1Q96NL6 688 aa11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 MED15Q96RN5 788 aa11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 CSRNP1Q96S65 589 aa11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 SALL1Q9NSC2 1324 aa11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 TSPY2A6NKD2 308 aa11.25□□□□□ -0.61
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TRPS1-211ENST00000520276 GCKP35557 465 aa11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 SMTNP53814 917 aa11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 SPRED3Q2MJR0 410 aa11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 FKBP15Q5T1M5 1219 aa11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 VCPKMTQ9H867 229 aa11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 TLDC1Q6P9B6 456 aa11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 MFSD6Q6ZSS7 791 aa11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 RASGRP2Q7LDG7 609 aa11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 SLC51AQ86UW1 340 aa11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa11.25□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 YDJCA8MPS7 323 aa11.24□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 KIF28PB7ZC32 967 aa11.24□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 SNX1Q13596 522 aa11.24□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 TFR2Q9UP52 801 aa11.24□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 ANKRD33BA6NCL7 494 aa11.24□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF18P17022 549 aa11.24□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 CMA1P23946 247 aa11.24□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 ARHGAP25P42331 645 aa11.24□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 TUBB4BP68371 445 aa11.24□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 TTMPQ5BVD1 217 aa11.24□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 ARMC3Q5W041 872 aa11.24□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 KCTD16Q68DU8 428 aa11.24□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa11.24□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 BEGAINQ9BUH8 593 aa11.24□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 NMRK2Q9NPI5 230 aa11.24□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 TUBBP07437 444 aa11.24□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 IREB2P48200 963 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 SDR42E1Q8WUS8 393 aa11.24□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa11.24□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 IFT88Q13099 833 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 MYSM1Q5VVJ2 828 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 NAA35Q5VZE5 725 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 SHC4Q6S5L8 630 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 PANX2Q96RD6 677 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 POLR3EQ9NVU0 708 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 A0A1B0GUA9 196 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 OPLAHO14841 1288 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 SEC24CP53992 1094 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 KRT32Q14532 448 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 RASA3Q14644 834 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 NR1I3Q14994 352 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 ACCSLQ4AC99 568 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 ZBTB10Q96DT7 871 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 USP17L12C9JPN9 530 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 USP17L21D6R901 530 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 YEATS4O95619 227 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 TSPY3P0CV98 308 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 TSPY8P0CW00 308 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 CDC25CP30307 473 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 GUCY1A3Q02108 690 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 TUBB2AQ13885 445 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 ARMC2Q8NEN0 867 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 TUBB2BQ9BVA1 445 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 ETAA1Q9NY74 926 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 ENO4A6NNW6 628 aa11.22□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 CASP14P31944 242 aa11.22□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 ADCY2Q08462 1091 aa11.22□□□□□ -0.61
TRPS1-211ENST00000520276 AP1ARQ63HQ0 302 aa11.22□□□□□ -0.61
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