RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519815.5

TRPS1-210, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRPS1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-210ENST00000519815 KLHL40Q2TBA0 621 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 USH1GQ495M9 461 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 MCTP2Q6DN12 878 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 CCDC174Q6PII3 467 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 C2orf69Q8N8R5 385 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 JMYQ8N9B5 988 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 RASGRP4Q8TDF6 673 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 ANP32EQ9BTT0 268 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 KCNH4Q9UQ05 1017 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 ATAD5Q96QE3 1844 aa11.92□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 FAM205CA6NFA0 338 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 IRF6O14896 467 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 CELF2O95319 508 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 BMP15O95972 392 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 ICAM1P05362 532 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 ME1P48163 572 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 PTPAQ15257 358 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 TTC38Q5R3I4 469 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 OPTNQ96CV9 577 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 HOXC10Q9NYD6 342 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 MYH6P13533 1939 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 ABCB11O95342 1321 aa11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 VWA5AO00534 786 aa11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 PPP6R2O75170 966 aa11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 CLK2P49760 499 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 INF2Q27J81 1249 aa11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 GPT2Q8TD30 523 aa11.9□□□□□ -0.5
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TRPS1-210ENST00000519815 TMEM260Q9NX78 707 aa11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 CCPG1Q9ULG6 757 aa11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 PCDHA7Q9UN72 937 aa11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 BOLA1Q9Y3E2 137 aa11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-210ENST00000519815 MYPNQ86TC9 1320 aa11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 FOSP01100 380 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 SNAPC2Q13487 334 aa11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF174Q15697 407 aa11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 UBE2SQ16763 222 aa11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 ADALQ6DHV7 355 aa11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 GADL1Q6ZQY3 521 aa11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 TBCKQ8TEA7 893 aa11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 ATG4CQ96DT6 458 aa11.89□□□□□ -0.51
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TRPS1-210ENST00000519815 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF536O15090 1300 aa11.88□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 A0A1W2PQ27 194 aa11.88□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 A0A1W2PQ64 194 aa11.88□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 A0A1W2PQD8 194 aa11.88□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 PIK3CDO00329 1044 aa11.88□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 MEIS2O14770 477 aa11.88□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 CUTAO60888 179 aa11.88□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 POLR2MP0CAP2 368 aa11.88□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
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TRPS1-210ENST00000519815 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP11.88□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 AP3B2Q13367 1082 aa11.88□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 CST9Q5W186 159 aa11.88□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 USP17L6PQ6QN14 398 aa11.88□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 NEK8Q86SG6 692 aa11.88□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 MCF2L2Q86YR7 1114 aa11.88□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 CPXCR1Q8N123 301 aa11.88□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 SAMD3Q8N6K7 520 aa11.88□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa11.88□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 SPDYE3A6NKU9 549 aa11.87□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 OPLAHO14841 1288 aa11.87□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 ATP2A1O14983 1001 aa11.87□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 ALAS1P13196 640 aa11.87□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 PTPREP23469 700 aa11.87□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 CMA1P23946 247 aa11.87□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 MCM7P33993 719 aa11.87□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 PTGDRQ13258 359 aa11.87□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 LETM2Q2VYF4 491 aa11.87□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 TREML2Q5T2D2 321 aa11.87□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
TRPS1-210ENST00000519815 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
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