RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519760.1

CDK1-208, Transcript of cyclin dependent kinase 1, human

TSL 3

Gene CDK1, Length 276 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDK1-208	ENST00000519760	MBLAC2	Q68D91	279 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	LILRA6	Q6PI73	481 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	CAPN10	Q9HC96	672 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	GULP1	Q9UBP9	304 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	RFXAP	O00287	272 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	SRGAP3	O43295	1099 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	TBX1	O43435	398 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	CYBB	P04839	570 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	GLI4	P10075	376 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	ATF2	P15336	505 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	FBLN1	P23142	703 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	MC3R	P41968	323 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	NR1I3	Q14994	352 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	PWWP2A	Q96N64	755 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	KCNC2	Q96PR1	638 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	APBA2	Q99767	749 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	CLEC1B	Q9P126	229 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	C7orf72	A4D263	438 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	ARNTL	O00327	626 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	PLS3	P13797	630 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	SCRN1	Q12765	414 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	GRB10	Q13322	594 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	SYT8	Q8NBV8	401 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	BVES	Q8NE79	360 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	MTA3	Q9BTC8	594 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDK1-208	ENST00000519760		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	THBD	P07204	575 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	PAM	P19021	973 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	CORO7	P57737	925 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	INF2	Q27J81	1249 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	LZTR1	Q8N653	840 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	DPF3	Q92784	378 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	COPS5	Q92905	334 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760		A0A1B0GTL3	188 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	FFAR3	O14843	346 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	FUCA1	P04066	466 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	ASGR2	P07307	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	TCF3	P15923	654 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	CTSW	P56202	376 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	FOXO4	P98177	505 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	FRS2	Q8WU20	508 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	SYT3	Q9BQG1	590 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	NTRK1	P04629	796 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	ITGAV	P06756	1048 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	PML	P29590	882 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	NCAPH	Q15003	741 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	USP33	Q8TEY7	942 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	ALG3	Q92685	438 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63	2e-8	■■■□□ 17.9
CDK1-208	ENST00000519760	TINF2	Q9BSI4	451 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	BTG4	Q9NY30	223 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	NPHS1	O60500	1241 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	DDAH1	O94760	285 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	FGR	P09769	529 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	PFKL	P17858	780 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDK1-208	ENST00000519760	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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