RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 N4BP3O15049 544 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 PTPN14Q15678 1187 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 UBE2SQ16763 222 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 GOLGA5Q8TBA6 731 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 MIEF2Q96C03 454 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 PSTPIP2Q9H939 334 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 MAN1B1Q9UKM7 699 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa8.77□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 SPDYE3A6NKU9 549 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 GH2P01242 217 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 PDHBP11177 359 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 CALCRLQ16602 461 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM47Q96LD4 638 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 KANSL2Q9H9L4 492 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 CTNND2Q9UQB3 1225 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM232C9JQI7 657 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 CYTH3O43739 400 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 EEF2P13639 858 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 KRT79Q5XKE5 535 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 HHIPL2Q6UWX4 724 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 ZFPM1Q8IX07 1006 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 NEK11Q8NG66 645 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 CUL5Q93034 780 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 AKT1S1Q96B36 256 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM260Q9NX78 707 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 LRWD1Q9UFC0 647 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 V9GYY5 206 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 FGRP09769 529 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 OR52Z1P0C646 297 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 USP8P40818 1118 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 AMPD3Q01432 767 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 GALNT17Q6IS24 598 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 CABP7Q86V35 215 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC26Q8TAB7 109 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 GOPCQ9HD26 462 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 EXOC1Q9NV70 894 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 RMND1Q9NWS8 449 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 C4BP0C0L5 1744 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 USP17L10C9JJH3 530 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 FUT2Q10981 343 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC144BQ3MJ40 725 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 TYW1BQ6NUM6 668 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 POTEAQ6S8J7 498 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 DYMQ7RTS9 669 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 GIMAP7Q8NHV1 300 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 LAMA4Q16363 1823 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 WNT7AO00755 349 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 CFBP00751 764 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 FAM163BP0C2L3 166 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 STYK1Q6J9G0 422 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 SNX29Q8TEQ0 813 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 KIFC2Q96AC6 838 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 PAGE5Q96GU1 130 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 VPS16Q9H269 839 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 SH3GLB2Q9NR46 395 aa8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF232Q9UNY5 417 aa8.75□□□□□ -1.01
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TRPS1-208ENST00000519076 USP17L15C9J2P7 530 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 USP17L13C9JLJ4 530 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 USP17L11C9JVI0 530 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 USP17L18D6R9N7 530 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 USP17L22D6RA61 530 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 USP17L17D6RBQ6 530 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 USP17L19D6RCP7 530 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 USP17L20D6RJB6 530 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 PSMA7O14818 248 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 LONP1P36776 959 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 NT5C2P49902 561 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 PDE4DQ08499 809 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 USP17L24Q0WX57 530 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 PSMD2Q13200 908 aa8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
TRPS1-208ENST00000519076 USP17L6PQ6QN14 398 aa8.74□□□□□ -1.01
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