RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519057.5

COPS5-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 5, human

TSL 4

Gene COPS5, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS5-208	ENST00000519057	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		7.39	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	COPS5	Q92905	334 aa		7.39	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	C20orf173	Q96LM9	149 aa		7.39	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		7.39	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		7.39	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	AKT3	Q9Y243	479 aa		7.39	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	PRR5	P85299	388 aa		7.38	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		7.38	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	MTA3	Q9BTC8	594 aa		7.38	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	LGR4	Q9BXB1	951 aa		7.38	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		7.38	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		7.38	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057		A0A1W2PQJ5	194 aa		7.37	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	KCNH1	O95259	989 aa		7.37	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	CYP4F3	Q08477	520 aa		7.37	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	NCAPH	Q15003	741 aa		7.37	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	MBLAC2	Q68D91	279 aa		7.37	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	BVES	Q8NE79	360 aa		7.37	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	C7orf72	A4D263	438 aa		7.36	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057		F8W031	263 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	ATF2	P15336	505 aa		7.36	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	TCF3	P15923	654 aa		7.36	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	PAM	P19021	973 aa		7.36	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	LIMS1	P48059	325 aa		7.36	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	VMAC	Q2NL98	169 aa		7.36	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF428	Q96B54	188 aa		7.36	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		7.36	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	PWWP2A	Q96N64	755 aa		7.36	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	APBA2	Q99767	749 aa		7.36	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		7.36	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	CAPN10	Q9HC96	672 aa		7.36	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	GULP1	Q9UBP9	304 aa		7.36	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		7.35	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057		B2RBV5	119 aa		7.35	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	SCRN1	Q12765	414 aa		7.35	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		7.35	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	LZTR1	Q8N653	840 aa		7.35	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		7.35	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		7.35	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	CLEC1B	Q9P126	229 aa		7.35	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		7.34	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	FGR	P09769	529 aa		7.34	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	PLS3	P13797	630 aa		7.34	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	PFKL	P17858	780 aa		7.34	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		7.34	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		7.34	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		7.34	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		7.34	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	TINF2	Q9BSI4	451 aa		7.34	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		7.34	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		7.34	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		7.34	□□□□□ -1.23
COPS5-208	ENST00000519057	TBX1	O43435	398 aa		7.33	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	THBD	P07204	575 aa		7.33	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	ASGR2	P07307	311 aa		7.33	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	NAT2	P11245	290 aa		7.33	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	ETFB	P38117	255 aa		7.33	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	MC3R	P41968	323 aa		7.33	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	CTSW	P56202	376 aa		7.33	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	CAP1	Q01518	475 aa		7.33	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	TNNI3K	Q59H18	835 aa		7.33	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		7.33	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		7.33	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	NETO2	Q8NC67	525 aa		7.33	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		7.33	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	DPF3	Q92784	378 aa		7.33	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	MMP19	Q99542	508 aa		7.33	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	RNF38	Q9H0F5	515 aa		7.33	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		7.33	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		7.33	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		7.33	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	FFAR3	O14843	346 aa		7.32	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	7.32	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	VWA3B	Q502W6	1294 aa		7.32	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	CABP7	Q86V35	215 aa		7.32	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		7.32	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		7.32	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	FRS2	Q8WU20	508 aa		7.32	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	7.32	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	ARNTL	O00327	626 aa		7.31	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	NPHS1	O60500	1241 aa		7.31	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	PML	P29590	882 aa		7.31	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	HTRA3	P83110	453 aa		7.31	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	FOXO4	P98177	505 aa		7.31	□□□□□ -1.24
COPS5-208	ENST00000519057	INF2	Q27J81	1249 aa		7.31	□□□□□ -1.24

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