RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517871.1

RRNAD1-208, Transcript of ribosomal RNA adenine dimethylase domain containing 1, human

TSL 3

Gene RRNAD1, Length 479 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRNAD1-208	ENST00000517871	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	FAM205C	A6NFA0	338 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	ATP2A1	O14983	1001 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	GNA11	P29992	359 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	DSG3	P32926	999 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	FBXO11	Q86XK2	927 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	C6orf50	Q9HD87	102 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	SMCO2	A6NFE2	343 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	FLOT1	O75955	427 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	YEATS4	O95619	227 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	ICAM1	P05362	532 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	TRAPPC10	P48553	1259 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	CCNA1	P78396	465 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	TRAF1	Q13077	416 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	PTPA	Q15257	358 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	MB21D1	Q8N884	522 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	13.43	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	CFAP45	Q9UL16	551 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	PIK3CD	O00329	1044 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	VWA5A	O00534	786 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	MEIS2	O14770	477 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	EDIL3	O43854	480 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	OAZ1	P54368	228 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	SNAP25	P60880	206 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	ERVK-9	P63128	1117 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	ERVK-24	P63145	666 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	ANO1	Q5XXA6	986 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	BICD2	Q8TD16	824 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	KIFC2	Q96AC6	838 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	TRIM47	Q96LD4	638 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	SRRD	Q9UH36	339 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	PNMA2	Q9UL42	364 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	ABCB11	O95342	1321 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	WNT7A	O00755	349 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	PTMS	P20962	102 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	MAPK4	P31152	587 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	ADCY7	P51828	1080 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	CAP1	Q01518	475 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871		Q3C1V9	767 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	CUL5	Q93034	780 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	ATG4C	Q96DT6	458 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	MAF1	Q9H063	256 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	CLIC4	Q9Y696	253 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	FIBP	O43427	364 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	CNMD	O75829	334 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	CTGF	P29279	349 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	SLC39A14	Q15043	492 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	PGBD1	Q96JS3	809 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RRNAD1-208	ENST00000517871	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RRNAD1-208	ENST00000517871	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	13.39	□□□□□ -0.27
RRNAD1-208	ENST00000517871	AP3B2	Q13367	1082 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RRNAD1-208	ENST00000517871	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RRNAD1-208	ENST00000517871	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RRNAD1-208	ENST00000517871	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RRNAD1-208	ENST00000517871	MCTP2	Q6DN12	878 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RRNAD1-208	ENST00000517871	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RRNAD1-208	ENST00000517871	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	13.39	□□□□□ -0.27
RRNAD1-208	ENST00000517871	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		13.39	□□□□□ -0.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms