RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CD3EP07766 207 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DGKGP49619 791 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NEK3P51956 506 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PURAQ00577 322 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RALBP1Q15311 655 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MINDY4Q4G0A6 757 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM177Q53S58 311 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FRS2Q8WU20 508 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CHST7Q9NS84 486 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 B4GALT6Q9UBX8 382 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 USP25Q9UHP3 1055 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 INTUQ9ULD6 942 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WASHC2AQ641Q2 1341 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC189A1A4V9 331 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 K7ESF4 209 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FZD9O00144 591 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MSCO60682 206 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRAMEF1O95521 474 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FOSP01100 380 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRIM27P14373 513 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DNM2P50570 870 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 POU4F1Q01851 419 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OCRLQ01968 901 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAPQ12884 760 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 INAVAQ3KP66 663 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PGM2L1Q6PCE3 622 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FBXO11Q86XK2 927 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CPA6Q8N4T0 437 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CHST14Q8NCH0 376 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 COPS5Q92905 334 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAXDC2Q96IV6 333 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ALG1Q9BT22 464 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC13A1Q9BZW2 595 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UBA5Q9GZZ9 404 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRR13Q9NZ81 148 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RNF112Q9ULX5 631 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GIT1Q9Y2X7 761 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ST14Q9Y5Y6 855 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PTPDC1A2A3K4 754 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARNTLO00327 626 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SIGLEC6O43699 453 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LCP1P13796 627 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PAK1Q13153 545 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PICALMQ13492 652 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ODF1Q14990 250 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LAPTM4AQ15012 233 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPAT2Q6NUI2 795 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SARGQ9BW04 601 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TCF7L1Q9HCS4 588 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GPR27Q9NS67 375 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TAGLN3Q9UI15 199 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RCAN3Q9UKA8 241 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM50BQ9Y247 325 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BACE2Q9Y5Z0 518 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A0A0A0MRY4 1105 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C2orf71A6NGG8 1288 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AURKAO14965 403 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ADAMTS2O95450 1211 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SOD2P04179 222 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CYP2C19P33261 490 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SESN3P58005 492 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RAC1P63000 192 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GRM3Q14832 879 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CRTC3Q6UUV7 619 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LBX2Q6XYB7 198 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
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