RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-223ENST00000515011 TNNT1P13805 278 aa25.72■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 PRCPP42785 496 aa25.72■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 PDIA5Q14554 519 aa25.72■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 ADSSL1Q8N142 457 aa25.72■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 RAB34Q9BZG1 259 aa25.72■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 LRWD1Q9UFC0 647 aa25.72■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 MYH7BA7E2Y1 1941 aa25.71■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 PTPN21Q16825 1174 aa25.71■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 NYAP1Q6ZVC0 841 aa25.71■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 MTMR14Q8NCE2 650 aa25.71■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP25.71■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 C7orf25Q9BPX7 421 aa25.71■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 FKBP1CQ5VVH2 108 aa25.71■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 BTNL9Q6UXG8 535 aa25.71■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 NIM1KQ8IY84 436 aa25.71■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 AGBL3Q8NEM8 1001 aa25.71■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 TRIM9Q9C026 710 aa25.71■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
PDE4D-223ENST00000515011 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 BMP3P12645 472 aa25.7■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 SYDE2Q5VT97 1194 aa25.7■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 GRB10Q13322 594 aa25.69■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 AMNQ9BXJ7 453 aa25.69■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 STK17AQ9UEE5 414 aa25.69■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 A0A1W2PRG0 241 aa25.69■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP25.69■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 AMPD3Q01432 767 aa25.69■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 SPAG1Q07617 926 aa25.68■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 AP3B2Q13367 1082 aa25.68■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 PNMA5Q96PV4 448 aa25.68■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 USP17L15C9J2P7 530 aa25.68■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 USP17L13C9JLJ4 530 aa25.68■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 USP17L11C9JVI0 530 aa25.68■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 USP17L18D6R9N7 530 aa25.68■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 USP17L22D6RA61 530 aa25.68■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 USP17L17D6RBQ6 530 aa25.68■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 USP17L19D6RCP7 530 aa25.68■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 USP17L20D6RJB6 530 aa25.68■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 DYNC1I1O14576 645 aa25.68■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 PBX1P40424 430 aa25.68■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 USP17L24Q0WX57 530 aa25.68■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 FILIP1LQ4L180 1135 aa25.68■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 MCTP2Q6DN12 878 aa25.68■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 USP17L6PQ6QN14 398 aa25.68■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa25.68■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 TGFB2P61812 414 aa25.67■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 STIM1Q13586 685 aa25.67■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 TMEM139Q8IV31 216 aa25.67■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 HAS1Q92839 578 aa25.67■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 ANO3Q9BYT9 981 aa25.67■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 PIM2Q9P1W9 311 aa25.67■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 POTEMA6NI47 508 aa25.66■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 LRRC10BA6NIK2 292 aa25.66■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 TEX33O43247 280 aa25.66■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 COBLO75128 1261 aa25.66■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 USP11P51784 963 aa25.66■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 PTPN14Q15678 1187 aa25.66■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 FBXO11Q86XK2 927 aa25.66■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa25.66■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa25.66■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 H7C1D1 291 aa25.66■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 MEIS2O14770 477 aa25.66■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 GOLGA8FQ08AF8 430 aa25.66■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa25.66■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 IKQ13123 557 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 TC2NQ8N9U0 490 aa25.66■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 TBC1D12O60347 775 aa25.65■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 MMP14P50281 582 aa25.65■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 ASIC1P78348 528 aa25.65■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 KRT31Q15323 416 aa25.65■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 TMEM119Q4V9L6 283 aa25.65■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 CEP135Q66GS9 1140 aa25.65■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 MOXD1Q6UVY6 613 aa25.65■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 FAM83AQ86UY5 434 aa25.65■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa25.65■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 MBOAT7Q96N66 472 aa25.65■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 EXOC1Q9NV70 894 aa25.65■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa25.65■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 TMX2Q9Y320 296 aa25.65■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa25.65■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 PSMA7O14818 248 aa25.65■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 CYP3A7P24462 503 aa25.65■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 KRT79Q5XKE5 535 aa25.65■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 SV2BQ7L1I2 683 aa25.65■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 FCHSD1Q86WN1 690 aa25.65■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 SNX29Q8TEQ0 813 aa25.65■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa25.65■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 VEZTQ9HBM0 779 aa25.65■■□□□ 1.7
PDE4D-223ENST00000515011 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa25.65■■□□□ 1.7
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