RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514829.5

FAM149A-216, Transcript of family with sequence similarity 149 member A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAM149A, Length 1,791 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149A-216ENST00000514829 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM149A-216ENST00000514829 KLHL10Q6JEL2 608 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM149A-216ENST00000514829 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM149A-216ENST00000514829 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM149A-216ENST00000514829 TBCKQ8TEA7 893 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM149A-216ENST00000514829 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
FAM149A-216ENST00000514829 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM149A-216ENST00000514829 GGA3Q9NZ52 723 aa22.16■■□□□ 1.14
FAM149A-216ENST00000514829 CCP110O43303 1012 aa22.15■■□□□ 1.14
FAM149A-216ENST00000514829 CDC25AP30304 524 aa22.15■■□□□ 1.14
FAM149A-216ENST00000514829 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa22.15■■□□□ 1.14
FAM149A-216ENST00000514829 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
FAM149A-216ENST00000514829 MTMR8Q96EF0 704 aa22.15■■□□□ 1.14
FAM149A-216ENST00000514829 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.15■■□□□ 1.14
FAM149A-216ENST00000514829 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.15■■□□□ 1.14
FAM149A-216ENST00000514829 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.15■■□□□ 1.14
FAM149A-216ENST00000514829 PGAP2Q9UHJ9 254 aa22.15■■□□□ 1.14
FAM149A-216ENST00000514829 CTNND2Q9UQB3 1225 aa22.15■■□□□ 1.14
FAM149A-216ENST00000514829 PP2D1A8MPX8 630 aa22.15■■□□□ 1.14
FAM149A-216ENST00000514829 MYH4Q9Y623 1939 aa22.14■■□□□ 1.14
FAM149A-216ENST00000514829 TUBB4AP04350 444 aa22.14■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 TNNI2P48788 182 aa22.14■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 STX17P56962 302 aa22.14■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa22.14■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 CABP7Q86V35 215 aa22.14■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.14■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 MKL1Q969V6 931 aa22.14■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa22.14■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.14■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 CTIFO43310 598 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 RRP9O43818 475 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 PAK1Q13153 545 aa22.13■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 TNFAIP1Q13829 316 aa22.13■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 TMEM139Q8IV31 216 aa22.13■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 COA7Q96BR5 231 aa22.13■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.13■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 NYAP2Q9P242 653 aa22.13■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 PBX1P40424 430 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 TEPSINQ96N21 525 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 TMEM260Q9NX78 707 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 KLRC4O43908 158 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 CLK2P49760 499 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 SPAG1Q07617 926 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 IGSF22Q8N9C0 903 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 DCAF4Q8WV16 495 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 MTMR9Q96QG7 549 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 ZBTB5O15062 677 aa22.11■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 ARHGAP6O43182 974 aa22.11■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 EPHX2P34913 555 aa22.11■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 CCDC96Q2M329 555 aa22.11■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.11■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.11■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 TC2NQ8N9U0 490 aa22.11■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 NELFBQ8WX92 580 aa22.11■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 MAP7D2Q96T17 732 aa22.11■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 WDR90Q96KV7 1748 aa22.11■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 SCN4AP35499 1836 aa22.11■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 POTECB2RU33 542 aa22.1■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 RHOBTB3O94955 611 aa22.1■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 PLCG1P19174 1290 aa22.1■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 FILIP1LQ4L180 1135 aa22.1■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.1■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.1■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 POTEDQ86YR6 584 aa22.1■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 ADSSL1Q8N142 457 aa22.1■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 LRRC15Q8TF66 581 aa22.1■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.1■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 ITIH6Q6UXX5 1313 aa22.1■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 EDIL3O43854 480 aa22.1■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 SYCP1Q15431 976 aa22.1■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 KMT5BQ4FZB7 885 aa22.1■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 GDAQ9Y2T3 454 aa22.1■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 LRRC10BA6NIK2 292 aa22.09■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 STX10O60499 249 aa22.09■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 GDF11O95390 407 aa22.09■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 PRCPP42785 496 aa22.09■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 PTPN21Q16825 1174 aa22.09■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 CUL5Q93034 780 aa22.09■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.09■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 GLT8D2Q9H1C3 349 aa22.09■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 TEX33O43247 280 aa22.08■■□□□ 1.13
FAM149A-216ENST00000514829 CALCRLQ16602 461 aa22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms