RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC26A6Q9BXS9 759 aa7.55□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 UNC93B1Q9H1C4 597 aa7.55□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 SPC25Q9HBM1 224 aa7.55□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 RTEL1Q9NZ71 1219 aa7.55□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 GPR37L1O60883 481 aa7.55□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 PDHBP11177 359 aa7.55□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 NAPAP54920 295 aa7.55□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa7.55□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 ADD1P35611 737 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 ARHGEF16Q5VV41 709 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 RNF207Q6ZRF8 634 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 DGKHQ86XP1 1220 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 TRIM22Q8IYM9 498 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 SPIRE2Q8WWL2 714 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 PHKBQ93100 1093 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 ACAD9Q9H845 621 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 FOXP2O15409 715 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 PGK1P00558 417 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 CCL5P13501 91 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 MCTP1Q6DN14 999 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 ADGRF4Q8IZF3 695 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 TMTC2Q8N394 836 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 MB21D1Q8N884 522 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 NECAB1Q8N987 351 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 NKX2-3Q8TAU0 364 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 NOD1Q9Y239 953 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 TACC3Q9Y6A5 838 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 GUCY1B3Q02153 619 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 QRICH1Q2TAL8 776 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 LBX2Q6XYB7 198 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM184AQ8NB25 1140 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 TTC14Q96N46 770 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 NFIBO00712 420 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 SEC24BO95487 1268 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 BCRP11274 1271 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 MAP3K10Q02779 954 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF543Q08ER8 600 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 PGBD1Q96JS3 809 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 AMNQ9BXJ7 453 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP7.53□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 POTEFA5A3E0 1075 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 EVI5O60447 810 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 PLEKHA8P1O95397 391 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC25A27O95847 323 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 PCP11498 1178 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 DCAF4Q8WV16 495 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 SOCS4Q8WXH5 440 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 UBXN4Q92575 508 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 TBC1D5Q92609 795 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 C22orf23Q9BZE7 217 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 MROH8Q9H579 483 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 SNX14Q9Y5W7 946 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 SPDYE3A6NKU9 549 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 CTGFP29279 349 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 GNASQ5JWF2 1037 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM87BQ96K49 555 aa7.53□□□□□ -1.2
RRN3P1-201ENST00000514813 NBPF3Q9H094 633 aa7.53□□□□□ -1.2
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RRN3P1-201ENST00000514813 HMGCRP04035 888 aa7.52□□□□□ -1.21
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RRN3P1-201ENST00000514813 GNAQP50148 359 aa7.52□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 NLRP5P59047 1200 aa7.52□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 ASPRV1Q53RT3 343 aa7.52□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 MUM1L1Q5H9M0 696 aa7.52□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 FANCBQ8NB91 859 aa7.52□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 SLAIN1Q8ND83 568 aa7.52□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 RMDN3Q96TC7 470 aa7.52□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 AP5M1Q9H0R1 490 aa7.52□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa7.52□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa7.52□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 RARBP10826 455 aa7.52□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 SYN1P17600 705 aa7.52□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 CAP1Q01518 475 aa7.52□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 TRIM29Q14134 588 aa7.52□□□□□ -1.21
RRN3P1-201ENST00000514813 USP17L6PQ6QN14 398 aa7.52□□□□□ -1.21
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