RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514402.1

MATR3-223, Transcript of matrin 3, human

TSL 2

Gene MATR3, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-223	ENST00000514402	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	IQCE	Q6IPM2	695 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	RPTN	Q6XPR3	784 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	CABP7	Q86V35	215 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		6.69	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402		B2RBV5	119 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	AGRP	O00253	132 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	RFXAP	O00287	272 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	KLF4	O43474	513 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	NPHS1	O60500	1241 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	GJB6	O95452	261 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	CP	P00450	1065 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	DDR2	Q16832	855 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	SV2C	Q496J9	727 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	C1QL4	Q86Z23	238 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	NETO2	Q8NC67	525 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	6.68	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	NUDT19	A8MXV4	375 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	ITGAV	P06756	1048 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	GLI4	P10075	376 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	SDHB	P21912	280 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	TESK1	Q15569	626 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	ZNF385B	Q569K4	471 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	TMC6	Q7Z403	805 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	LZTR1	Q8N653	840 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	MZB1	Q8WU39	189 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	C7orf72	A4D263	438 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	THBD	P07204	575 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	LDHD	Q86WU2	507 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	ARMC5	Q96C12	935 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	NBPF4	Q96M43	638 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	IRAK3	Q9Y616	596 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	NUAK1	O60285	661 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	PLS3	P13797	630 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	CDR1	P51861	262 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	KCNAB2	Q13303	367 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	RAB33A	Q14088	237 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	SGSM3	Q96HU1	749 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	MTA3	Q9BTC8	594 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	SGPP1	Q9BX95	441 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	RNF38	Q9H0F5	515 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	CLEC1B	Q9P126	229 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MATR3-223	ENST00000514402	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MATR3-223	ENST00000514402	ZBTB7A	O95365	584 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MATR3-223	ENST00000514402	CAPNS1	P04632	268 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MATR3-223	ENST00000514402	PFKL	P17858	780 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MATR3-223	ENST00000514402	GTF2A2	P52657	109 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MATR3-223	ENST00000514402	SLC9A5	Q14940	896 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MATR3-223	ENST00000514402	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
MATR3-223	ENST00000514402	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MATR3-223	ENST00000514402	FRS2	Q8WU20	508 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MATR3-223	ENST00000514402	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MATR3-223	ENST00000514402	PEX11G	Q96HA9	241 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MATR3-223	ENST00000514402	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MATR3-223	ENST00000514402	KCTD3	Q9Y597	815 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MATR3-223	ENST00000514402	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
MATR3-223	ENST00000514402	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
MATR3-223	ENST00000514402	TACR1	P25103	407 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MATR3-223	ENST00000514402	EPHB3	P54753	998 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MATR3-223	ENST00000514402	GFRA1	P56159	465 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MATR3-223	ENST00000514402	CAP1	Q01518	475 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MATR3-223	ENST00000514402	CYP4F3	Q08477	520 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MATR3-223	ENST00000514402	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MATR3-223	ENST00000514402	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MATR3-223	ENST00000514402	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MATR3-223	ENST00000514402	GULP1	Q9UBP9	304 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MATR3-223	ENST00000514402	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
MATR3-223	ENST00000514402	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MATR3-223	ENST00000514402		F8W031	263 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
MATR3-223	ENST00000514402	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35

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