RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512069.6

PDE4D-220, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4D, Length 536 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-220ENST00000512069 CYP4F3Q08477 520 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-220ENST00000512069 SCRN1Q12765 414 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-220ENST00000512069 SLC10A6Q3KNW5 377 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-220ENST00000512069 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-220ENST00000512069 SGSM3Q96HU1 749 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-220ENST00000512069 LGR4Q9BXB1 951 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-220ENST00000512069 PDLIM7Q9NR12 457 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-220ENST00000512069 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-220ENST00000512069 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-220ENST00000512069 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-220ENST00000512069 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa7.15□□□□□ -1.26
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PDE4D-220ENST00000512069 CPP00450 1065 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-220ENST00000512069 MSL3P1P0C860 447 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-220ENST00000512069 GLDCP23378 1020 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-220ENST00000512069 DLG4P78352 724 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-220ENST00000512069 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
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PDE4D-220ENST00000512069 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
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PDE4D-220ENST00000512069 CCDC113Q9H0I3 377 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-220ENST00000512069 GPRC5CQ9NQ84 441 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-220ENST00000512069 SIRPGQ9P1W8 387 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-220ENST00000512069 A0A1W2PQU0 124 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 IQCA1LA6NCM1 817 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 TCAF2A6NFQ2 919 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 TBX1O43435 398 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 THBDP07204 575 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 MED14OSP0DP75 135 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 PLS3P13797 630 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 SOGA3Q5TF21 947 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 IQCEQ6IPM2 695 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 CPNE8Q86YQ8 564 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 NPLOC4Q8TAT6 608 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 FRS2Q8WU20 508 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 TOX2Q96NM4 488 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 CD320Q9NPF0 282 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 KLHL14Q9P2G3 628 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 C7orf72A4D263 438 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 NR1I3Q14994 352 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 KCNA10Q16322 511 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 C1QL4Q86Z23 238 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 KREMEN2Q8NCW0 462 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 GCM1Q9NP62 436 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 CLEC1BQ9P126 229 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 SRGAP3O43295 1099 aa7.12□□□□□ -1.27
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PDE4D-220ENST00000512069 VIPR1P32241 457 aa7.12□□□□□ -1.27
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PDE4D-220ENST00000512069 MTA3Q9BTC8 594 aa7.12□□□□□ -1.27
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PDE4D-220ENST00000512069 NUDT19A8MXV4 375 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 ARNTLO00327 626 aa7.11□□□□□ -1.27
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PDE4D-220ENST00000512069 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
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PDE4D-220ENST00000512069 SERINC3Q13530 473 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 RASGRF1Q13972 1273 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 RAB3GAP1Q15042 981 aa7.11□□□□□ -1.27
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PDE4D-220ENST00000512069 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 OLFML2BQ68BL8 750 aa7.11□□□□□ -1.27
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PDE4D-220ENST00000512069 LRP10Q7Z4F1 713 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 SIRT5Q9NXA8 310 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 CYBBP04839 570 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 DBHP09172 617 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 ECI1P42126 302 aa7.1□□□□□ -1.27
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PDE4D-220ENST00000512069 LINC00310P59036 64 aa7.1□□□□□ -1.27
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PDE4D-220ENST00000512069 LCNL1Q6ZST4 164 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 LZTR1Q8N653 840 aa7.1□□□□□ -1.27
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PDE4D-220ENST00000512069 EPHB3P54753 998 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 MAP4K2Q12851 820 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 INF2Q27J81 1249 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 MBLAC2Q68D91 279 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 BICRALQ6AI39 1079 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
PDE4D-220ENST00000512069 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
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