RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506436.1

LARS-208, Transcript of leucyl-tRNA synthetase, human

TSL 3

Gene LARS, Length 539 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LARS-208	ENST00000506436	FSD1	Q9BTV5	496 aa		13.15	□□□□□ -0.3
LARS-208	ENST00000506436	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
LARS-208	ENST00000506436	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		13.15	□□□□□ -0.3
LARS-208	ENST00000506436	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
LARS-208	ENST00000506436	CLDND1	Q9NY35	253 aa		13.15	□□□□□ -0.3
LARS-208	ENST00000506436	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		13.15	□□□□□ -0.3
LARS-208	ENST00000506436	PTPRS	Q13332	1948 aa		13.15	□□□□□ -0.3
LARS-208	ENST00000506436	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	ZNF292	O60281	2723 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	MBTPS2	O43462	519 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	RAD21	O60216	631 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	CXCL10	P02778	98 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	AVPR2	P30518	371 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	NBL1	P41271	181 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	CNTN2	Q02246	1040 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	IKBKE	Q14164	716 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	ACAD9	Q9H845	621 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	COG6	Q9Y2V7	657 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		13.14	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	RAD50	Q92878	1312 aa		13.13	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	MYH8	P13535	1937 aa		13.13	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	STXBP3	O00186	592 aa		13.13	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	SELP	P16109	830 aa		13.13	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	LTBR	P36941	435 aa		13.13	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	SLC4A3	P48751	1232 aa		13.13	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	RBL2	Q08999	1139 aa		13.13	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	EPC2	Q52LR7	807 aa		13.13	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		13.13	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	PLXNA3	P51805	1871 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	ACACB	O00763	2458 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	CDK8	P49336	464 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	GPM6B	Q13491	265 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	TKFC	Q3LXA3	575 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	CCDC184	Q52MB2	194 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	MCTP2	Q6DN12	878 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	RPAIN	Q86UA6	219 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		13.12	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436		F5H6K3	240 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436		H0Y858	1186 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	MYL3	P08590	195 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	EVX2	Q03828	476 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	KLRC3	Q07444	240 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	GPNMB	Q14956	572 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	MORC4	Q8TE76	937 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	TLR9	Q9NR96	1032 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	FEM1B	Q9UK73	627 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		13.11	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	COL4A6	Q14031	1691 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	13.1	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	PTGIS	Q16647	500 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	SESTD1	Q86VW0	696 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	KIFC2	Q96AC6	838 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	NYAP2	Q9P242	653 aa		13.1	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436		A6NJR5	290 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	EYA4	O95677	639 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	NDUFB10	O96000	172 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	AMH	P03971	560 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	GNAI2	P04899	355 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	CYP2D6	P10635	497 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	C12orf60	Q5U649	245 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	FBXO11	Q86XK2	927 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	ASIC4	Q96FT7	647 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	CD207	Q9UJ71	328 aa		13.09	□□□□□ -0.31
LARS-208	ENST00000506436	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32

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