RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TOX2Q96NM4 488 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NKX3-2P78367 333 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAAP100Q0VG06 881 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SEC23AQ15436 765 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MROH7Q68CQ1 1323 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LAMA3Q16787 3333 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIAA0355O15063 1070 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZEB2O60315 1214 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PTGS1P23219 599 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PDE4DQ08499 809 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GPR153Q6NV75 609 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 Q9Y3F1 56 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ABCB11O95342 1321 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ERICH2A1L162 156 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARVCFO00192 962 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ITGB8P26012 769 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM63BQ5T3F8 832 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CXCL17Q6UXB2 119 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FBXO11Q86XK2 927 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RGS22Q8NE09 1264 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DNERQ8NFT8 737 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WDR11Q9BZH6 1224 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 JMJD4Q9H9V9 463 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYH6P13533 1939 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 B4DLN1 442 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 E7EWF7 191 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CDK7P50613 346 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SHHQ15465 462 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 QRICH1Q2TAL8 776 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 STAG2Q8N3U4 1231 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NCOA7Q8NI08 942 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KLRF2D3W0D1 207 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CABYRO75952 493 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DUSP28Q4G0W2 176 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DEFB123Q8N688 67 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAP4K1Q92918 833 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SART3Q15020 963 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C9orf50Q5SZB4 431 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MCF2L2Q86YR7 1114 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TBC1D5Q92609 795 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TAF6LQ9Y6J9 622 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TLR3O15455 904 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CHST3Q7LGC8 479 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAF1Q9H063 256 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FPGSQ05932 587 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WTAPQ15007 396 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 Q7L0L9 218 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAD2L2Q9UI95 211 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TIMP1P01033 207 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EDNRBP24530 442 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ITGA7Q13683 1181 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 STOX1Q6ZVD7 989 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TAAR1Q96RJ0 339 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AMNQ9BXJ7 453 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TBX21Q9UL17 535 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPP2R5BQ15173 497 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM67Q5HYA8 995 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM126BQ8IXS8 530 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR6J1Q8NGC5 347 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SCFD2Q8WU76 684 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SENP2Q9HC62 589 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GRM4Q14833 912 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RMDN3Q96TC7 470 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZBTB5O15062 677 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP27.12■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CFBP00751 764 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TXNP10599 105 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CPT1AP50416 773 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EPHB4P54760 987 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PSMC6P62333 389 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CATIPQ7Z7H3 387 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HOMER1Q86YM7 354 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC43A3Q8NBI5 491 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 POLR3EQ9NVU0 708 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COL20A1Q9P218 1284 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYL3P08590 195 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARHGEF16Q5VV41 709 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MFSD5Q6N075 450 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MTMR8Q96EF0 704 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa27.11■■□□□ 1.93
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa27.11■■□□□ 1.93
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