RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503362.1

SPCS3-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS3, Length 4,571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3-201ENST00000503362 UBAP1LF5GYI3 381 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 ATP1A2P50993 1020 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 MAP3K9P80192 1104 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 EHHADHQ08426 723 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 MAN2A1Q16706 1144 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 PRR16Q569H4 304 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 MOCS3O95396 460 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 GNGT1P63211 74 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 CCDC25Q86WR0 208 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 REXO1L1PQ8IX06 675 aa14.65□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SPCS3-201ENST00000503362 TNFAIP3P21580 790 aa14.65□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 CLEC4GQ6UXB4 293 aa14.65□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 MAEAQ7L5Y9 396 aa14.65□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 CCDC170Q8IYT3 715 aa14.65□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 HDAC6Q9UBN7 1215 aa14.65□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 MON2Q7Z3U7 1717 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 CCDC121Q6ZUS5 278 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 STAG2Q8N3U4 1231 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 GIMAP7Q8NHV1 300 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 CHP1Q99653 195 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 NDST4Q9H3R1 872 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 LEMD3Q9Y2U8 911 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 XDHP47989 1333 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 NTRK3Q16288 839 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 MYCT1Q8N699 235 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 BCAS4Q8TDM0 211 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 TMEM47Q9BQJ4 181 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 GNA14O95837 355 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 SLC16A2P36021 539 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 GUCY2DQ02846 1103 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 PLVAPQ9BX97 442 aa14.64□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 VGLL3A8MV65 326 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 DPYDQ12882 1025 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 BICD1Q96G01 975 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 CYP4A11Q02928 519 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 TXNRD1Q16881 649 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 KCTD16Q68DU8 428 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 DAAM2Q86T65 1068 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 RDH13Q8NBN7 331 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 LRRC45Q96CN5 670 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 VEZTQ9HBM0 779 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 CFBP00751 764 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 INPP5BP32019 993 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 CDK8P49336 464 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 KIF11P52732 1056 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 SMIM5Q71RC9 77 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 GPATCH11Q8N954 259 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 JRKLQ9Y4A0 524 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 ATP2B4P23634 1241 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa14.63□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 SLC7A5Q01650 507 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 FBXL16Q8N461 479 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 SH3GLB2Q9NR46 395 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 ABCB4P21439 1286 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 TPH2Q8IWU9 490 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 CCDC114Q96M63 670 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 CAPS2Q9BXY5 557 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 STK17AQ9UEE5 414 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 ARHGAP44Q17R89 818 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 KCTD1Q719H9 257 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 PPM1EQ8WY54 764 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa14.62□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 ANKRD62A6NC57 917 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 GJC1P36383 396 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 UBE2SQ16763 222 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 CEP85LQ5SZL2 805 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 OGFOD1Q8N543 542 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 EXOC3O60645 756 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.071e-6■■■■□ 25.6
SPCS3-201ENST00000503362 DOK7Q18PE1 504 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 KRT12Q99456 494 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 POTEMA6NI47 508 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 ORC4O43929 436 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 FTCDO95954 541 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 VSNL1P62760 191 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 PEAK1Q9H792 1746 aa14.61□□□□□ -0.07
SPCS3-201ENST00000503362 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms