RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 CYP4F3Q08477 520 aa6.09□□□□□ -1.43
POLR1B-215ENST00000498054 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.09□□□□□ -1.43
POLR1B-215ENST00000498054 RCSD1Q6JBY9 416 aa6.09□□□□□ -1.43
POLR1B-215ENST00000498054 BRAPQ7Z569 592 aa6.09□□□□□ -1.43
POLR1B-215ENST00000498054 CPNE8Q86YQ8 564 aa6.09□□□□□ -1.43
POLR1B-215ENST00000498054 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa6.09□□□□□ -1.43
POLR1B-215ENST00000498054 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.09□□□□□ -1.43
POLR1B-215ENST00000498054 DIO2Q92813 273 aa6.09□□□□□ -1.43
POLR1B-215ENST00000498054 CHAMP1Q96JM3 812 aa6.09□□□□□ -1.43
POLR1B-215ENST00000498054 PTCHD1Q96NR3 888 aa6.09□□□□□ -1.43
POLR1B-215ENST00000498054 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.09□□□□□ -1.43
POLR1B-215ENST00000498054 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
POLR1B-215ENST00000498054 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
POLR1B-215ENST00000498054 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
POLR1B-215ENST00000498054 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.08□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 OPA1O60313 960 aa6.08□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 SDSP20132 328 aa6.08□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 LTBRP36941 435 aa6.08□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 ANAPC15P60006 121 aa6.08□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 GUCY1A3Q02108 690 aa6.08□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 TEKQ02763 1124 aa6.08□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 MISP3Q96FF7 219 aa6.08□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 C1orf159Q96HA4 380 aa6.08□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.08□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.08□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa6.08□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 ASXL2Q76L83 1435 aa6.08□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa6.07□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM82A0PJX8 343 aa6.07□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 AQP7O14520 342 aa6.07□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 CRTAMO95727 393 aa6.07□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 LCP1P13796 627 aa6.07□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 NEK4P51957 841 aa6.07□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 IGBP1P78318 339 aa6.07□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 ZP2Q05996 745 aa6.07□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 TM4SF20Q53R12 229 aa6.07□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 IQCEQ6IPM2 695 aa6.07□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 STYK1Q6J9G0 422 aa6.07□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 FGD2Q7Z6J4 655 aa6.07□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 JAMLQ86YT9 394 aa6.07□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 IFNL3Q8IZI9 196 aa6.07□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 STK11IPQ8N1F8 1099 aa6.07□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 UBR7Q8N806 425 aa6.07□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 GPATCH3Q96I76 525 aa6.07□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 TMX1Q9H3N1 280 aa6.07□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 BTG4Q9NY30 223 aa6.07□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 SLAMF8Q9P0V8 285 aa6.07□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa6.07□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.07□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 MYO1BO43795 1136 aa6.06□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 PDE8AO60658 829 aa6.06□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 RASGRP1O95267 797 aa6.06□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 KCNAB2Q13303 367 aa6.06□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 MSMPQ1L6U9 139 aa6.06□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 TRIM61Q5EBN2 209 aa6.06□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 LRRTM3Q86VH5 581 aa6.06□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 CCDC103Q8IW40 242 aa6.06□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.06□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 FMNL2Q96PY5 1086 aa6.06□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 TRIM39Q9HCM9 518 aa6.06□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 BTBD11A6QL63 1104 aa6.05□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 CD8BP10966 210 aa6.05□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 FLT3P36888 993 aa6.05□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 TXKP42681 527 aa6.05□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 GPR85P60893 370 aa6.05□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 INF2Q27J81 1249 aa6.05□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa6.05□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 CYP2R1Q6VVX0 501 aa6.05□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 RCBTB1Q8NDN9 531 aa6.05□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 FLCNQ8NFG4 579 aa6.05□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 SCLYQ96I15 445 aa6.05□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 MMP19Q99542 508 aa6.05□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 ALG1Q9BT22 464 aa6.05□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.05□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 PCDH12Q9NPG4 1184 aa6.05□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 GPR27Q9NS67 375 aa6.05□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.05□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 A0A1W2PQ27 194 aa6.04□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 A0A1W2PQ64 194 aa6.04□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 A0A1W2PQC6 194 aa6.04□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 A0A1W2PQD8 194 aa6.04□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 ARNTLO00327 626 aa6.04□□□□□ -1.44
POLR1B-215ENST00000498054 NPHS1O60500 1241 aa6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms