RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497842.6

TTC19-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 19, human

TSL 5

Gene TTC19, Length 1,360 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC19-208	ENST00000497842	CHST13	Q8NET6	341 aa		32.65	■■■□□ 2.82
TTC19-208	ENST00000497842	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		32.65	■■■□□ 2.82
TTC19-208	ENST00000497842	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	32.64	■■■□□ 2.82
TTC19-208	ENST00000497842		M0R2N6	131 aa		32.64	■■■□□ 2.82
TTC19-208	ENST00000497842	PIK3CD	O00329	1044 aa		32.64	■■■□□ 2.82
TTC19-208	ENST00000497842	POLR2M	P0CAP2	368 aa		32.64	■■■□□ 2.82
TTC19-208	ENST00000497842	CCNA1	P78396	465 aa		32.64	■■■□□ 2.82
TTC19-208	ENST00000497842	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		32.64	■■■□□ 2.82
TTC19-208	ENST00000497842	MAF1	Q9H063	256 aa		32.64	■■■□□ 2.82
TTC19-208	ENST00000497842	ACAD9	Q9H845	621 aa		32.64	■■■□□ 2.82
TTC19-208	ENST00000497842	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		32.64	■■■□□ 2.82
TTC19-208	ENST00000497842	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	32.64	■■■□□ 2.82
TTC19-208	ENST00000497842	FBXO40	Q9UH90	709 aa		32.64	■■■□□ 2.82
TTC19-208	ENST00000497842	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		32.64	■■■□□ 2.82
TTC19-208	ENST00000497842	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		32.64	■■■□□ 2.82
TTC19-208	ENST00000497842	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		32.63	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	CFB	P00751	764 aa		32.63	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		32.63	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		32.63	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	TNFRSF25	Q93038	417 aa		32.63	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		32.63	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	NFIB	O00712	420 aa		32.62	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	ADAMTS3	O15072	1205 aa		32.62	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	UBE2S	Q16763	222 aa		32.62	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		32.62	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		32.62	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	32.62	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	MEIS2	O14770	477 aa		32.61	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	PEX10	O60683	326 aa		32.61	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		32.61	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		32.61	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	GHRHR	Q02643	423 aa		32.6	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	AP3B2	Q13367	1082 aa		32.6	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		32.6	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		32.6	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	MROH8	Q9H579	483 aa		32.6	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		32.6	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	HSD17B4	P51659	736 aa		32.59	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842		Q3C1V9	767 aa		32.59	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		32.59	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	TMEM260	Q9NX78	707 aa		32.59	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		32.58	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	ERCC3	P19447	782 aa		32.58	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	32.58	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		32.58	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	NSMF	Q6X4W1	530 aa		32.58	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		32.58	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	TBC1D5	Q92609	795 aa		32.58	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	TCHH	Q07283	1943 aa		32.58	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	TLR2	O60603	784 aa		32.58	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
TTC19-208	ENST00000497842	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		32.57	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		32.57	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		32.57	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	CPA4	Q9UI42	421 aa		32.57	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		32.56	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	CRHR2	Q13324	411 aa		32.56	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	ATL3	Q6DD88	541 aa		32.56	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		32.56	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	PFAS	O15067	1338 aa		32.55	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	FAM205C	A6NFA0	338 aa		32.55	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	BCR	P11274	1271 aa		32.55	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	TRAPPC10	P48553	1259 aa		32.55	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	32.55	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		32.55	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	ANO3	Q9BYT9	981 aa		32.55	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	32.54	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	WDR78	Q5VTH9	848 aa		32.54	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	C17orf99	Q6UX52	265 aa		32.54	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		32.54	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	32.53	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		32.53	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		32.53	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	CFAP45	Q9UL16	551 aa		32.53	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	PLXNB2	O15031	1838 aa		32.53	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	KRT85	P78386	507 aa		32.52	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	INF2	Q27J81	1249 aa		32.52	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	TBCK	Q8TEA7	893 aa		32.52	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	PGBD1	Q96JS3	809 aa		32.52	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	GBP4	Q96PP9	640 aa		32.52	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	PORCN	Q9H237	461 aa		32.52	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		32.52	■■■□□ 2.8
TTC19-208	ENST00000497842	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	MAPK4	P31152	587 aa		32.51	■■■□□ 2.79
TTC19-208	ENST00000497842	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		32.51	■■■□□ 2.79

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