RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495113.5

TMBIM1-223, Transcript of transmembrane BAX inhibitor motif containing 1, human

TSL 2

Gene TMBIM1, Length 596 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMBIM1-223	ENST00000495113	POSTN	Q15063	836 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	IL17A	Q16552	155 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	CALCRL	Q16602	461 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	SPECC1	Q5M775	1068 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	RNF214	Q8ND24	703 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	EPSTI1	Q96J88	318 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	MTMR9	Q96QG7	549 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	MAF1	Q9H063	256 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	CUEDC2	Q9H467	287 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	CSAD	Q9Y600	493 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	RLF	Q13129	1914 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	USP17L15	C9J2P7	530 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	USP17L11	C9JVI0	530 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	USP17L18	D6R9N7	530 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	USP17L22	D6RA61	530 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	USP17L19	D6RCP7	530 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	USP17L20	D6RJB6	530 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	TBX3	O15119	743 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	ZBED4	O75132	1171 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	SMC2	O95347	1197 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	CYP3A4	P08684	503 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	POLR2M	P0CAP2	368 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	OAZ1	P54368	228 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	NLRP12	P59046	1061 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	SNAP25	P60880	206 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	USP17L24	Q0WX57	530 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	PDIA5	Q14554	519 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	CCDC174	Q6PII3	467 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	LDHD	Q86WU2	507 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	POTED	Q86YR6	584 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	ADM5	C9JUS6	153 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	OPLAH	O14841	1288 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	FLOT1	O75955	427 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	TDP2	O95551	362 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	MYL1	P05976	194 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	CIITA	P33076	1130 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	UBA7	P41226	1012 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	ZNF165	P49910	485 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	ARHGAP4	P98171	946 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	SEMA3F	Q13275	785 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	E2F4	Q16254	413 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	USP49	Q70CQ1	688 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	DHX58	Q96C10	678 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	CDCA5	Q96FF9	252 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	PANK2	Q9BZ23	570 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	DISC1	Q9NRI5	854 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	STK24	Q9Y6E0	443 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113		A0A0G2JMZ2	1700 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	UNCX	A6NJT0	531 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	SLC37A4	O43826	429 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	EDIL3	O43854	480 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	VGLL4	Q14135	290 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113		Q4G0T1	1027 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	CABP7	Q86V35	215 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	PDILT	Q8N807	584 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	SPATA20	Q8TB22	786 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	SMARCE1	Q969G3	411 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMBIM1-223	ENST00000495113	CBX8	Q9HC52	389 aa		13.73	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms