RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
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PRAME-213ENST00000492657 MYH7BA7E2Y1 1941 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-213ENST00000492657 USP17L15C9J2P7 530 aa14.37□□□□□ -0.11
PRAME-213ENST00000492657 USP17L13C9JLJ4 530 aa14.37□□□□□ -0.11
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PRAME-213ENST00000492657 USP17L18D6R9N7 530 aa14.37□□□□□ -0.11
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