RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492069.5

SLC5A6-218, Transcript of solute carrier family 5 member 6, humanhuman

TSL 3

Gene SLC5A6, Length 705 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A6-218ENST00000492069 VCAM1P19320 739 aa14.83□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 NF2P35240 595 aa14.83□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 IREB2P48200 963 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 SARSP49591 514 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 MTMR2Q13614 643 aa14.83□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 UBE2SQ16763 222 aa14.83□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 KRT26Q7Z3Y9 468 aa14.83□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 LDHDQ86WU2 507 aa14.83□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 MCF2L2Q86YR7 1114 aa14.83□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 IGSF22Q8N9C0 903 aa14.83□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 SPATA20Q8TB22 786 aa14.83□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 EPSTI1Q96J88 318 aa14.83□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 PPP1R9BQ96SB3 815 aa14.83□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 EHMT1Q9H9B1 1298 aa14.83□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 MAGEF1Q9HAY2 307 aa14.83□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 CCDC39Q9UFE4 941 aa14.83□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 ZHX2Q9Y6X8 837 aa14.83□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 USP17L15C9J2P7 530 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 USP17L13C9JLJ4 530 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 USP17L11C9JVI0 530 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 USP17L18D6R9N7 530 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 USP17L22D6RA61 530 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 USP17L17D6RBQ6 530 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 USP17L19D6RCP7 530 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 USP17L20D6RJB6 530 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 ATP2A1O14983 1001 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 ZBED4O75132 1171 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 POLR2MP0CAP2 368 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 NLRP12P59046 1061 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 CCDC173Q0VFZ6 552 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 USP17L24Q0WX57 530 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 POSTNQ15063 836 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 E2F4Q16254 413 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 CALCRLQ16602 461 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 Q4G0T1 1027 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 ANO6Q4KMQ2 910 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 SPECC1Q5M775 1068 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 USP17L6PQ6QN14 398 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 USP49Q70CQ1 688 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 CEP57L1Q8IYX8 460 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 STK24Q9Y6E0 443 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 WDR90Q96KV7 1748 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 ZNF536O15090 1300 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 SMC2O95347 1197 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 UBA7P41226 1012 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 ZNF165P49910 485 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 ARHGAP4P98171 946 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 PPATQ06203 517 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 TMEM266Q2M3C6 531 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 USH1GQ495M9 461 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 SLFN12Q8IYM2 578 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 TMOD4Q9NZQ9 345 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 SERTAD1Q9UHV2 236 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 CSADQ9Y600 493 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 CXCL11O14625 94 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 FLOT1O75955 427 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 DSG3P32926 999 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 HSD17B4P51659 736 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 SNAP25P60880 206 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 COG2Q14746 738 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 KCTD17Q8N5Z5 321 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 PAGE5Q96GU1 130 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 PDLIM2Q96JY6 352 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 FAM20AQ96MK3 541 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 GSDMAQ96QA5 445 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 KCNMB3Q9NPA1 279 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 DISC1Q9NRI5 854 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 FBXO28Q9NVF7 368 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 PHIPQ8WWQ0 1821 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 A0A087X0B3 334 aa14.79□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 ADM5C9JUS6 153 aa14.79□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 VWA5AO00534 786 aa14.79□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 TDP2O95551 362 aa14.79□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 VGLL4Q14135 290 aa14.79□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 TKFCQ3LXA3 575 aa14.79□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 PDXDC2PQ6P474 469 aa14.79□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 CCDC174Q6PII3 467 aa14.79□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 ERO1BQ86YB8 467 aa14.79□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 POTEDQ86YR6 584 aa14.79□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 MLKLQ8NB16 471 aa14.79□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 RNF214Q8ND24 703 aa14.79□□□□□ -0.04
SLC5A6-218ENST00000492069 SMARCE1Q969G3 411 aa14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms